More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2959 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  100 
 
 
346 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  93.06 
 
 
346 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  80.23 
 
 
346 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  57.45 
 
 
338 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  54.09 
 
 
339 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  56.17 
 
 
323 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  56.79 
 
 
323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  52.21 
 
 
352 aa  352  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  50.73 
 
 
343 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  51.34 
 
 
339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  51.49 
 
 
334 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  55.69 
 
 
338 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  55.69 
 
 
338 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  55.39 
 
 
338 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  48.8 
 
 
338 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  48.95 
 
 
338 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  48.35 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  51.54 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  49.22 
 
 
334 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  48.8 
 
 
328 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  50.82 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  50.98 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  49.51 
 
 
339 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  45.95 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  49.24 
 
 
348 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  44.44 
 
 
348 aa  263  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  45.83 
 
 
341 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  45.59 
 
 
334 aa  255  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  45.54 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.83 
 
 
341 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  44 
 
 
322 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  43.67 
 
 
340 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  43.93 
 
 
314 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
333 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.51 
 
 
313 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.12 
 
 
328 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.3 
 
 
336 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.12 
 
 
336 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.12 
 
 
336 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.43 
 
 
336 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.87 
 
 
339 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  40.12 
 
 
336 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  41.87 
 
 
339 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  41.87 
 
 
339 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.14 
 
 
321 aa  222  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.24 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.82 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  39.82 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.82 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.82 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
334 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.38 
 
 
345 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  42.25 
 
 
326 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  39.53 
 
 
378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.12 
 
 
337 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.8 
 
 
350 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  40 
 
 
308 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.64 
 
 
334 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  43.33 
 
 
334 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
322 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.43 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.31 
 
 
395 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  45.21 
 
 
309 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  34.83 
 
 
356 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  31.52 
 
 
319 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  28.71 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  31.12 
 
 
323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  30.06 
 
 
316 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.45 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  30.6 
 
 
317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.91 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  27.71 
 
 
412 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  30.94 
 
 
309 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  27.16 
 
 
323 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  25.7 
 
 
326 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  27.78 
 
 
326 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  25.54 
 
 
314 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.16 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  24.92 
 
 
326 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  28.48 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.15 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  28.04 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  24.92 
 
 
326 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  24.92 
 
 
326 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.92 
 
 
326 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  28.16 
 
 
323 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.61 
 
 
326 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  26.93 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.04 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.04 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.04 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  25.94 
 
 
312 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  25.94 
 
 
312 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.46 
 
 
308 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.61 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.74 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  25.23 
 
 
309 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>