More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3226 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  100 
 
 		 339 aa  687    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  76.33 
 
 		 339 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  75.15 
 
 		 339 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  52.47 
 
 		 322 aa  319  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  45.26 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  50.49 
 
 		 346 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  50.82 
 
 		 346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  48.49 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  47.57 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.55 
 
 		 339 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  45.59 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  50.82 
 
 		 346 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  46.54 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  43.08 
 
 		 338 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.08 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.91 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  46.69 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  46.33 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.04 
 
 		 352 aa  261  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  46.91 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.46 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.26 
 
 		 341 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  41.59 
 
 		 343 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  41.79 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  41.64 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  43.6 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  43.6 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.31 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  38.37 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.1 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.13 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  41.53 
 
 		 334 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.53 
 
 		 334 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.57 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  39.44 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  41.85 
 
 		 340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  40.69 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  40 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  39.63 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  39.64 
 
 		 334 aa  208  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.08 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.08 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.63 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.63 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.63 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.32 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  39.63 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  41.9 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.48 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.74 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.45 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  43.55 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.96 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  38.96 
 
 		 339 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  38.96 
 
 		 339 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.35 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  36.24 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  35.26 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.64 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  36.89 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  35.62 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  33.54 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.52 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.66 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  29.22 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.31 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  30.5 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  31.06 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  31.4 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  31.58 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  28.48 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  27.71 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  28.06 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  27.38 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  30.38 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  27.81 
 
 		 370 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  27.81 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  27.81 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  29.25 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  28.79 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  29.07 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  29.02 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  25.45 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  26.35 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  28.83 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  26.07 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  26.92 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  28.12 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  25.83 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  28.37 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4035  aldo/keto reductase  27.46 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  25.07 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4493  aldo/keto reductase  27.46 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  27.52 
 
 		 298 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  28.53 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.43 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  25 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  24.92 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>