More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0762 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  100 
 
 
321 aa  637    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  59.42 
 
 
314 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  54.93 
 
 
326 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  55.21 
 
 
313 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  55.59 
 
 
333 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  58.63 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  53.07 
 
 
345 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  53.05 
 
 
334 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  46.52 
 
 
334 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  51.99 
 
 
328 aa  262  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  45.19 
 
 
328 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  48.69 
 
 
322 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  46.15 
 
 
373 aa  245  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  43.69 
 
 
340 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  44.52 
 
 
334 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  45.28 
 
 
332 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  41.36 
 
 
339 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.49 
 
 
338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.37 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.39 
 
 
339 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.74 
 
 
346 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.4 
 
 
346 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  47.65 
 
 
348 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  40.56 
 
 
338 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
341 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.69 
 
 
341 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  41.67 
 
 
354 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.1 
 
 
339 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  39.58 
 
 
343 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  41.36 
 
 
338 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.56 
 
 
338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  43.35 
 
 
329 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  42.24 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  39.1 
 
 
322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  41.14 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.28 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.58 
 
 
323 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.65 
 
 
323 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  42.14 
 
 
348 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.38 
 
 
339 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.5 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  38.36 
 
 
334 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.91 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  38.73 
 
 
378 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.59 
 
 
336 aa  178  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.59 
 
 
336 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.59 
 
 
336 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  36.57 
 
 
334 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.59 
 
 
336 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.76 
 
 
336 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.59 
 
 
336 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.76 
 
 
336 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  39.14 
 
 
334 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.29 
 
 
336 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.14 
 
 
334 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  37.81 
 
 
340 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  36.28 
 
 
337 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.48 
 
 
350 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  36.81 
 
 
356 aa  163  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
339 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
339 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.66 
 
 
339 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  34.69 
 
 
323 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  30.65 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.23 
 
 
323 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  32.7 
 
 
395 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  32.31 
 
 
319 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  32.5 
 
 
316 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  36.03 
 
 
299 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  32.29 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  32.08 
 
 
325 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  31.27 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  30.03 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.31 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  31.33 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.31 
 
 
311 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.31 
 
 
311 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.31 
 
 
311 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  30.38 
 
 
309 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.31 
 
 
311 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  29 
 
 
317 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  30.79 
 
 
343 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.23 
 
 
311 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  30.67 
 
 
331 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  22.44 
 
 
312 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  28.43 
 
 
331 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  24.18 
 
 
326 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  30.6 
 
 
318 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  32.58 
 
 
314 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  29.82 
 
 
344 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  28.43 
 
 
311 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.92 
 
 
311 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  24.84 
 
 
309 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  28.26 
 
 
343 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  29.82 
 
 
389 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
342 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  29.22 
 
 
325 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  30.03 
 
 
344 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>