More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4948 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  100 
 
 
326 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  61.66 
 
 
314 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  59.49 
 
 
334 aa  330  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  54.93 
 
 
321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  56.91 
 
 
313 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  54.66 
 
 
333 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  55.84 
 
 
328 aa  309  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  53.94 
 
 
345 aa  291  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  50.16 
 
 
373 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  47.5 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  59.23 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  46.91 
 
 
332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  47.94 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  48.41 
 
 
322 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  45.57 
 
 
354 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  45.87 
 
 
341 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  44.75 
 
 
334 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.51 
 
 
341 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  43.93 
 
 
338 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.34 
 
 
346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
329 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.2 
 
 
339 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  43.83 
 
 
340 aa  235  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.82 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.49 
 
 
338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.4 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  42.25 
 
 
334 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  45.22 
 
 
308 aa  232  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  41.44 
 
 
338 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.69 
 
 
339 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  42.25 
 
 
346 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.37 
 
 
323 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  39.52 
 
 
339 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  39.32 
 
 
339 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
322 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.04 
 
 
338 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.42 
 
 
343 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.58 
 
 
339 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  36.98 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  42.51 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  43.73 
 
 
338 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  43.73 
 
 
338 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.98 
 
 
336 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.38 
 
 
338 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
334 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.51 
 
 
336 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.51 
 
 
336 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  38.86 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
340 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.6 
 
 
334 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  39.27 
 
 
334 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.15 
 
 
336 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.9 
 
 
336 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.84 
 
 
336 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.84 
 
 
336 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.84 
 
 
336 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.84 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.99 
 
 
348 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.94 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.77 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.23 
 
 
395 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  35.28 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  34.93 
 
 
356 aa  162  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  34.24 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.84 
 
 
323 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.5 
 
 
299 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  30.56 
 
 
322 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  31 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  32.32 
 
 
323 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  30.56 
 
 
316 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  32.72 
 
 
325 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.69 
 
 
312 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  30.63 
 
 
317 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  31.03 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  30.3 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  31.55 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.21 
 
 
312 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  28.3 
 
 
314 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  30.55 
 
 
329 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  28.53 
 
 
314 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  28.39 
 
 
309 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  28.31 
 
 
333 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  27.42 
 
 
308 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  27.74 
 
 
308 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  27.3 
 
 
305 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  27.56 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  32.91 
 
 
342 aa  95.9  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  25.71 
 
 
330 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  25.95 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  28.8 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  26.21 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  28.16 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  26.98 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  25.76 
 
 
312 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  25.76 
 
 
312 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.94 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  26.77 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  31.62 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>