More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1922 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  100 
 
 
316 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  51.49 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  54.1 
 
 
319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  51.85 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  50.67 
 
 
323 aa  318  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  47.99 
 
 
325 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  46.32 
 
 
412 aa  265  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  39.33 
 
 
326 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.22 
 
 
313 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  33.55 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  36.76 
 
 
333 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.65 
 
 
343 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  32.5 
 
 
321 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  34.33 
 
 
354 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  34.03 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  31.31 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.77 
 
 
346 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  34.38 
 
 
314 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  31.51 
 
 
323 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29 
 
 
339 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29.43 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  32 
 
 
334 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  32.2 
 
 
348 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.7 
 
 
338 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  31.15 
 
 
334 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.04 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  30.43 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.04 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  28.7 
 
 
338 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  31.29 
 
 
332 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  32.32 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  30.38 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  29.97 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  30.22 
 
 
338 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  31.53 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.71 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  38.71 
 
 
309 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.72 
 
 
312 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  33.21 
 
 
308 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.28 
 
 
336 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.28 
 
 
336 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29.66 
 
 
338 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  32.12 
 
 
329 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  30.98 
 
 
323 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.21 
 
 
373 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  33.74 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.02 
 
 
323 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  31.71 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  31.71 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.44 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  31.83 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  29 
 
 
336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.8 
 
 
338 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.57 
 
 
328 aa  116  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  26.85 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  31.03 
 
 
345 aa  115  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.7 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.7 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.13 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.7 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.79 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  31.85 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.81 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  28.48 
 
 
336 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  28.13 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  30.65 
 
 
334 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  30.06 
 
 
346 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.97 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.42 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.39 
 
 
350 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  27.91 
 
 
334 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.53 
 
 
337 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  28.39 
 
 
356 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.97 
 
 
339 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  29.93 
 
 
339 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  31.46 
 
 
322 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  29.93 
 
 
339 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  30.4 
 
 
344 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  26.35 
 
 
376 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  29.05 
 
 
378 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  29.77 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  27.78 
 
 
395 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  26.46 
 
 
345 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  29.08 
 
 
341 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  29.6 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2595  aldo/keto reductase  28.35 
 
 
325 aa  92.8  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  30.38 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  29.52 
 
 
344 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  25.77 
 
 
361 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  27.85 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  30.94 
 
 
316 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  29.28 
 
 
338 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  28.52 
 
 
336 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  26.17 
 
 
358 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  28.89 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  28.19 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3413  aldo/keto reductase  28.03 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  25.75 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  27.66 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  35.09 
 
 
334 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>