More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1225 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  100 
 
 		 338 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  95.67 
 
 		 323 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  86.07 
 
 		 323 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  69.46 
 
 		 339 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  70.96 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  70.96 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  70.06 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  57.55 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  56.84 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  54.57 
 
 		 346 aa  361  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  57.45 
 
 		 346 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  51.75 
 
 		 343 aa  345  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  51.32 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  46.15 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.43 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  46.15 
 
 		 339 aa  301  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.56 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  46.91 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  47.35 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  45.9 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.59 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  48.53 
 
 		 348 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.9 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  44.15 
 
 		 340 aa  269  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  46.06 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  46.83 
 
 		 341 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.6 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  46.13 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.52 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  44.86 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.48 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.48 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.23 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.23 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  40.8 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  41.85 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  43.93 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.4 
 
 		 373 aa  222  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.36 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  41.77 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  41.77 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.94 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.3 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.46 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.02 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.02 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.72 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.72 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.72 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.72 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  42.15 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  39.01 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.15 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  48.28 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  40.19 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  40.31 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.04 
 
 		 350 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.18 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  40.75 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.65 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  36.09 
 
 		 356 aa  195  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  39.56 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.73 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  30.61 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.09 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  30.22 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  27.16 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  29.07 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  26.35 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.97 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  27.18 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  28.48 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 412 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  29.17 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  26.52 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  25.68 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  28.42 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.98 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.38 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.38 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1588  aldo/keto reductase  26.27 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1557  aldo/keto reductase  26.27 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.38 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.68 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.68 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.68 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  27.83 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.77 
 
 		 311 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.2 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.68 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  27.79 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  27.98 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  25.85 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1063  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.62 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.730153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  28.1 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  28.1 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0341  aldo/keto reductase  28.48 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000752262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>