More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1063 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1063  aldo/keto reductase family oxidoreductase  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.730153  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1557  aldo/keto reductase  77.74 
 
 		 302 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1588  aldo/keto reductase  77.74 
 
 		 302 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  53.21 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  51.48 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  51.85 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.85 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  51.85 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  51.85 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  50.37 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  50.54 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  51.48 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  51.66 
 
 		 304 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50 
 
 		 304 aa  272  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  47.12 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  42.95 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2795  aldo/keto reductase  46.8 
 
 		 304 aa  238  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  39.71 
 
 		 298 aa  208  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  31.49 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  31.38 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  29.62 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  31.54 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  30.46 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  29.84 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2706  aldo/keto reductase  29.9 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.315446  normal  0.0513811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  31.99 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42050  putative oxidoreductase  30.18 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  29.84 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  30.24 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  31.83 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  29.11 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  29.41 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  29.32 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  29.32 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  29.51 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  29.51 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  30.42 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3357  aldo/keto reductase  29.9 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  30.16 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0609138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  30.43 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  30.43 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.43 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.45 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  29.45 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.43 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  30.43 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.43 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  30.43 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.43 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.43 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.45 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  28.47 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  28.42 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  30.17 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  28.66 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  29.6 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  28.75 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  27.39 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1550  aldo/keto reductase  29.67 
 
 		 324 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  28.53 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  28.48 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  28.95 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  29.26 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  27.04 
 
 		 326 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  29.73 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.9 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6932  aldo/keto reductase  26.86 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  29.18 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4540  aldo/keto reductase  28.09 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1790  aldo/keto reductase  29.64 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0366045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  28.1 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  29.18 
 
 		 370 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  30.28 
 
 		 328 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0460  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.29 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  27.3 
 
 		 328 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3239  aldo/keto reductase  31.2 
 
 		 364 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13922  normal  0.0117807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  29.6 
 
 		 350 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  26.25 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  27.42 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  24.44 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  29.17 
 
 		 348 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0462  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.29 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1533  aldo/keto reductase  29.21 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.666942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.14 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.14 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  28.14 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  28.34 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  28.08 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  31.88 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0481  putative aryl-alcohol dehydrogenase W  28.62 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  29.64 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  27.61 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  40.52 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  27.96 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  28.88 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2757  aldo/keto reductase  27.27 
 
 		 382 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0729923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  29.71 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  29.57 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>