More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0462 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0462  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  100 
 
 
324 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0460  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  99.38 
 
 
324 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0523  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  99.07 
 
 
324 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0481  putative aryl-alcohol dehydrogenase W  99.38 
 
 
324 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0468  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  99.38 
 
 
324 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  92.9 
 
 
324 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  92.59 
 
 
324 aa  624  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  92.9 
 
 
324 aa  624  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  92.9 
 
 
324 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  92.59 
 
 
324 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  92.59 
 
 
324 aa  621  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  92.59 
 
 
324 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  92.59 
 
 
324 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  91.98 
 
 
324 aa  620  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  86.73 
 
 
324 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  72.84 
 
 
324 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  64.42 
 
 
326 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3842  aldo/keto reductase  65.03 
 
 
326 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3956  aldo/keto reductase  64.11 
 
 
326 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4526  aldo/keto reductase  65.03 
 
 
326 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150764  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5778  aldo/keto reductase  65.34 
 
 
326 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  64.62 
 
 
326 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  61.04 
 
 
326 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4419  aldo/keto reductase  63.8 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  60.42 
 
 
331 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  60.43 
 
 
326 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  62.39 
 
 
327 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  62.58 
 
 
326 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  60.43 
 
 
326 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4129  aldo/keto reductase  65.34 
 
 
326 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0121527  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  60.43 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  59.69 
 
 
325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  60.25 
 
 
324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1790  aldo/keto reductase  58.48 
 
 
331 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0366045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2263  aldo/keto reductase  59.69 
 
 
326 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  60.31 
 
 
326 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  59.82 
 
 
326 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  59.88 
 
 
343 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5093  aldo/keto reductase  62.27 
 
 
326 aa  394  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  61.54 
 
 
332 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4628  aldo/keto reductase  62.27 
 
 
326 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.1 
 
 
331 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0071932  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  59.69 
 
 
322 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2388  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
331 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2963  aldo/keto reductase  58.91 
 
 
331 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.947943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  58.9 
 
 
330 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5167  aldo/keto reductase  61.66 
 
 
326 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2556  aldo/keto reductase  56.8 
 
 
331 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  59.38 
 
 
346 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  60.62 
 
 
325 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  58.46 
 
 
342 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3237  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
326 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  59.31 
 
 
326 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  57.45 
 
 
326 aa  363  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  56.71 
 
 
325 aa  356  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  54.83 
 
 
349 aa  351  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  54.98 
 
 
334 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
349 aa  345  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02340  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  54.94 
 
 
336 aa  343  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  52.92 
 
 
325 aa  342  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  51.98 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  52.01 
 
 
328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  54.32 
 
 
323 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  51.69 
 
 
322 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  51.69 
 
 
322 aa  332  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  53.82 
 
 
326 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18200  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  50.31 
 
 
351 aa  331  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  52.58 
 
 
326 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  51.08 
 
 
326 aa  319  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  51.85 
 
 
324 aa  318  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  51.23 
 
 
332 aa  315  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  51.67 
 
 
325 aa  311  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
323 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0320  aldo/keto reductase  48.15 
 
 
337 aa  306  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  48.45 
 
 
326 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3357  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
326 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42050  putative oxidoreductase  50 
 
 
323 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4540  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
332 aa  298  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1550  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
324 aa  297  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
323 aa  295  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2362  aldo/keto reductase  47.72 
 
 
324 aa  295  9e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2706  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
325 aa  292  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.315446  normal  0.0513811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  45.2 
 
 
337 aa  291  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  48.45 
 
 
326 aa  289  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1164  aldo/keto reductase  48.48 
 
 
323 aa  288  9e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.123786 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2875  aldo/keto reductase  47.75 
 
 
323 aa  285  8e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.536931  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1533  aldo/keto reductase  47.29 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.666942 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  45.54 
 
 
326 aa  279  6e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  44.94 
 
 
337 aa  275  6e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1418  aldo/keto reductase  45.62 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3239  aldo/keto reductase  56.6 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13922  normal  0.0117807 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_09474  aldo-keto reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11260)  42.86 
 
 
348 aa  265  8e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.266976  normal  0.0773831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2826  aldo/keto reductase  46.03 
 
 
340 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02910  aryl-alcohol dehydrogenase, putative  43.73 
 
 
357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.345326  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6932  aldo/keto reductase  45.43 
 
 
345 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933917  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2469  aldo/keto reductase  43.34 
 
 
348 aa  248  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31613  aryl-alcohol dehydrogenases  39.6 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.732276 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.49 
 
 
339 aa  242  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.49 
 
 
339 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>