More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8210 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  100 
 
 
314 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  64.76 
 
 
333 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  61.66 
 
 
326 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  59.42 
 
 
321 aa  345  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  61.44 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  58.77 
 
 
328 aa  318  7e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  58.86 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  67.54 
 
 
309 aa  308  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  50.16 
 
 
328 aa  298  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  54.25 
 
 
373 aa  296  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  58.01 
 
 
345 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  50.48 
 
 
334 aa  287  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  52.6 
 
 
322 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  50.65 
 
 
332 aa  277  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  47.84 
 
 
340 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  47.32 
 
 
334 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  48.11 
 
 
308 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.58 
 
 
338 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
339 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  46.3 
 
 
341 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  45.99 
 
 
354 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  44.27 
 
 
338 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.37 
 
 
341 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  41.57 
 
 
343 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  44.86 
 
 
338 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.98 
 
 
346 aa  245  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.93 
 
 
346 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  47.66 
 
 
348 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.51 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.99 
 
 
339 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  45.2 
 
 
329 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.26 
 
 
323 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.85 
 
 
338 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  43.93 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  43.55 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.04 
 
 
352 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.68 
 
 
339 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.99 
 
 
339 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.44 
 
 
339 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  42.06 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.62 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
338 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
338 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.12 
 
 
338 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.38 
 
 
334 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  43.38 
 
 
334 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.18 
 
 
336 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.2 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.96 
 
 
336 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.96 
 
 
336 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  40.31 
 
 
378 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.34 
 
 
336 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.22 
 
 
336 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.02 
 
 
336 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.53 
 
 
336 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.71 
 
 
336 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.71 
 
 
336 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.62 
 
 
350 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  37.89 
 
 
340 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  38.55 
 
 
356 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.13 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
339 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
339 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.4 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  37.74 
 
 
323 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  36.48 
 
 
323 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  33.55 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  36.45 
 
 
299 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  33.67 
 
 
323 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
319 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  30.8 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  34.38 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  30.41 
 
 
322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  35.35 
 
 
325 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  31.85 
 
 
309 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  31.89 
 
 
323 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  33.11 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  31.27 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  30.5 
 
 
314 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  32.48 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0842  aryl-alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 
302 aa  114  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  26.6 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  26.6 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.17 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.6 
 
 
326 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  31.54 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.6 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  32.01 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  30.46 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  30.62 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  26.28 
 
 
326 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.28 
 
 
326 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.37 
 
 
342 aa  109  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.28 
 
 
326 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  28.05 
 
 
314 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  26.05 
 
 
326 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
304 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  32.93 
 
 
325 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>