More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6342 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  100 
 
 		 339 aa  685    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  74.77 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  74.77 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  75.08 
 
 		 338 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  69.46 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  71.56 
 
 		 323 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  70.62 
 
 		 323 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  53.39 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  53.1 
 
 		 346 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  52.41 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  51.18 
 
 		 352 aa  348  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  54.09 
 
 		 346 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  50.44 
 
 		 343 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  46.08 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.65 
 
 		 338 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  46.59 
 
 		 339 aa  299  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  46.39 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  46.65 
 
 		 329 aa  278  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  46.5 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.55 
 
 		 339 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  46.73 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.98 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.16 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.57 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.85 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  44.41 
 
 		 354 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  44.28 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  42.6 
 
 		 340 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  42.12 
 
 		 348 aa  235  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  41.29 
 
 		 322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  42.99 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.76 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.2 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.82 
 
 		 373 aa  222  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  41.9 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  42.2 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.81 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.29 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.61 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  40.18 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.63 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.63 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.83 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  41.36 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.11 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.92 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.92 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  40.31 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  41.54 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.92 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.92 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.92 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.92 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.38 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  36.76 
 
 		 395 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  44.98 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.38 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  35.4 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  38.94 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  37.2 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  39.26 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  37 
 
 		 308 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  30.56 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.36 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.96 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  28.44 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.48 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  26.89 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  26.83 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  27.16 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  27.69 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  27.61 
 
 		 412 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  28.85 
 
 		 326 aa  96.3  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  29.36 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  23.82 
 
 		 311 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  26.48 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  26.87 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  26.48 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.48 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.81 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.24 
 
 		 311 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  23.56 
 
 		 311 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  26.46 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.23 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  24.04 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.17 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  22.36 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  26.76 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25.86 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1063  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.68 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.730153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  25.77 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.86 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  28.17 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  22.36 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.92 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1588  aldo/keto reductase  24.68 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>