More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1187 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  100 
 
 
333 aa  651    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  64.76 
 
 
314 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  54.66 
 
 
326 aa  315  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  56.05 
 
 
313 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  55.59 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  55.24 
 
 
328 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  50.62 
 
 
328 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  63.12 
 
 
309 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  56.04 
 
 
334 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  53.35 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  48.48 
 
 
334 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  53.27 
 
 
345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  50 
 
 
373 aa  268  7e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  49.35 
 
 
332 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.35 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  46.5 
 
 
354 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.07 
 
 
346 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
341 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.22 
 
 
341 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  44.74 
 
 
346 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  45.45 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  45.95 
 
 
348 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  40 
 
 
339 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  43.67 
 
 
334 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  41.18 
 
 
338 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.5 
 
 
323 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.56 
 
 
338 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.79 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  45.11 
 
 
308 aa  225  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.36 
 
 
339 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
339 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.25 
 
 
323 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.48 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.66 
 
 
338 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  39.94 
 
 
343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
334 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.28 
 
 
352 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  41.87 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  41.87 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  39.26 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.96 
 
 
336 aa  195  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.85 
 
 
338 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.65 
 
 
336 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.34 
 
 
336 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.65 
 
 
336 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.65 
 
 
336 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.02 
 
 
336 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  36.83 
 
 
334 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.03 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  37.57 
 
 
378 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
334 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.15 
 
 
336 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.15 
 
 
336 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.96 
 
 
350 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  41.4 
 
 
340 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.01 
 
 
348 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  39.01 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  39.01 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.7 
 
 
339 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.54 
 
 
337 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  36.76 
 
 
316 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  33.74 
 
 
395 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
323 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  36.04 
 
 
356 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  35.08 
 
 
323 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  33.93 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  36.1 
 
 
299 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  32.43 
 
 
322 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  28.92 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  28.53 
 
 
323 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  34.13 
 
 
325 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  30.94 
 
 
317 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  30.25 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  25.77 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.78 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  25.77 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  31.95 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.77 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.46 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25.46 
 
 
326 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.46 
 
 
326 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  30.1 
 
 
318 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.08 
 
 
327 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  32.09 
 
 
326 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  25.85 
 
 
314 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  28.25 
 
 
306 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  29.56 
 
 
349 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  30.28 
 
 
331 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  30 
 
 
331 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  32.28 
 
 
349 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  30.03 
 
 
341 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  26.45 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  30.1 
 
 
331 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  26.02 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.62 
 
 
311 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  25.48 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>