More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4422 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  100 
 
 
323 aa  654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  91.46 
 
 
323 aa  592  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  67.19 
 
 
322 aa  454  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  71.01 
 
 
319 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  51.85 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  45.21 
 
 
412 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  44 
 
 
325 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  39.67 
 
 
326 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  35.19 
 
 
328 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  36.08 
 
 
313 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  34.69 
 
 
321 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  37.74 
 
 
314 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.47 
 
 
343 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
334 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.05 
 
 
352 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  34.69 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.86 
 
 
336 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  32.75 
 
 
354 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.86 
 
 
336 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  33.94 
 
 
326 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.72 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.86 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.86 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.86 
 
 
336 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.86 
 
 
336 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.86 
 
 
336 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.86 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  31.82 
 
 
339 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  32.66 
 
 
341 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  32.55 
 
 
323 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.77 
 
 
341 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  31.52 
 
 
339 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  29.46 
 
 
339 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  32.11 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  32.62 
 
 
334 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  32.38 
 
 
332 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  36.23 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  30.84 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.58 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  35.46 
 
 
328 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  30.36 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  32.36 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  30.61 
 
 
338 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  38.73 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  30.65 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  34.06 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.58 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.91 
 
 
339 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  32.04 
 
 
334 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  30.22 
 
 
323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.04 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  30.91 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  30.91 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.53 
 
 
323 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  29.55 
 
 
312 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.56 
 
 
339 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  33.22 
 
 
317 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.48 
 
 
336 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  30.7 
 
 
322 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.49 
 
 
373 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  32.72 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
329 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.97 
 
 
299 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  33.8 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  31.12 
 
 
346 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  30.15 
 
 
338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  30.15 
 
 
338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.3 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  28.57 
 
 
334 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.18 
 
 
338 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  33.03 
 
 
345 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  30.14 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  30.75 
 
 
330 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  30.61 
 
 
370 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  30.61 
 
 
351 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  26.63 
 
 
316 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  30.46 
 
 
342 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  30.3 
 
 
324 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  30.96 
 
 
378 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  29.22 
 
 
351 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  29.22 
 
 
351 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  29.6 
 
 
323 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  30.1 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.04 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  31.88 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  30.79 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  28.71 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  28.71 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.43 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2595  aldo/keto reductase  28.75 
 
 
325 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.71 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  28.71 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  27.88 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.71 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  28.71 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.71 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.38 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  28.22 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>