More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2031 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  100 
 
 
336 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  71.56 
 
 
340 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  72.32 
 
 
339 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  68.98 
 
 
336 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  68.98 
 
 
336 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  71.73 
 
 
339 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  71.73 
 
 
339 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  67.77 
 
 
336 aa  481  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  67.77 
 
 
336 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  67.47 
 
 
336 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  67.17 
 
 
336 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  66.87 
 
 
336 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  67.17 
 
 
336 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  63.69 
 
 
337 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  62.04 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  62.65 
 
 
334 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  62.65 
 
 
334 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  44.68 
 
 
378 aa  255  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.53 
 
 
350 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  43.5 
 
 
338 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.24 
 
 
395 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.47 
 
 
338 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  42.39 
 
 
339 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  44.65 
 
 
328 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  42.73 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.57 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  42.42 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.9 
 
 
346 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  41.09 
 
 
340 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.35 
 
 
346 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
329 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  40.98 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.07 
 
 
338 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
334 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  40 
 
 
323 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  39.94 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  42.3 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.61 
 
 
339 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  37.16 
 
 
334 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.51 
 
 
352 aa  202  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.74 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.64 
 
 
328 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  37.2 
 
 
348 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.96 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  39.57 
 
 
332 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  36.8 
 
 
322 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
326 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.17 
 
 
343 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.5 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.59 
 
 
313 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  40.18 
 
 
314 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  34.88 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.04 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.37 
 
 
345 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  34.88 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
322 aa  179  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.29 
 
 
321 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  38.11 
 
 
333 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  35.58 
 
 
308 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.82 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  32.05 
 
 
356 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.65 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  28.79 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  29.48 
 
 
323 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  25.62 
 
 
312 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  26.43 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  29.13 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.88 
 
 
323 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  30.91 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  26.96 
 
 
323 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  27.51 
 
 
317 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  26.69 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  25.81 
 
 
327 aa  92.4  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  27.33 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  24.92 
 
 
412 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  24.71 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.79 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  25.47 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.7 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  25.47 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.48 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.48 
 
 
311 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.48 
 
 
311 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  24.78 
 
 
311 aa  87  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.48 
 
 
311 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  27.97 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.85 
 
 
326 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  24.93 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0782  aldo/keto reductase  26.73 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16349  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  24.93 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.8 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2158  aldo/keto reductase  26.35 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  28.29 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  23.88 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  28.8 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  23.08 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>