More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1995 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  99.12 
 
 
354 aa  675    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  100 
 
 
341 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  89.74 
 
 
341 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  68.04 
 
 
340 aa  471  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  47.4 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  47.11 
 
 
338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  46.95 
 
 
339 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  48.26 
 
 
338 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  51.22 
 
 
329 aa  298  8e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  50.61 
 
 
348 aa  281  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  46.36 
 
 
334 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  48.18 
 
 
323 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.06 
 
 
339 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  47.72 
 
 
334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  44.44 
 
 
328 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  46.83 
 
 
338 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.94 
 
 
339 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.04 
 
 
323 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.91 
 
 
339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.28 
 
 
339 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.67 
 
 
346 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  48.5 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  48.17 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.9 
 
 
346 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  41.76 
 
 
343 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.32 
 
 
352 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  45.83 
 
 
346 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
340 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  46.55 
 
 
334 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  46.3 
 
 
314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  42.07 
 
 
348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  41.57 
 
 
334 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  43.24 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  45.87 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  40.3 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.73 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.3 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  40.61 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.11 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  46.53 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.64 
 
 
339 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.3 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.3 
 
 
336 aa  232  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.3 
 
 
336 aa  232  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.73 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.73 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.86 
 
 
321 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.58 
 
 
313 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
333 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  49.14 
 
 
309 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  45.29 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  45.29 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.71 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
332 aa  213  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.29 
 
 
373 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.72 
 
 
350 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.68 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  35.49 
 
 
378 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  36.34 
 
 
308 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.42 
 
 
395 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
322 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  32.64 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  34.03 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  33.62 
 
 
356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  32.66 
 
 
323 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.27 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.22 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.89 
 
 
299 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  26.13 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  31.31 
 
 
309 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  30.37 
 
 
325 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  29.18 
 
 
412 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  28.86 
 
 
326 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  27.48 
 
 
323 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  28.73 
 
 
315 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  30.33 
 
 
322 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  27.86 
 
 
326 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  27.48 
 
 
317 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.97 
 
 
308 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.79 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  27.35 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  28.13 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  27.14 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  28.66 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.06 
 
 
311 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  28.74 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  27.41 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  27.43 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  28.65 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.06 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  25.15 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.06 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  24.92 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.06 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  28.23 
 
 
339 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>