More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4755 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  100 
 
 		 334 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  98.2 
 
 		 334 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  92.47 
 
 		 334 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  62.65 
 
 		 340 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.75 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.75 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.24 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  60.24 
 
 		 336 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  60.54 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.24 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60.24 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60.24 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  64.51 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  65.12 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  65.12 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  62.65 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  59.94 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  48.94 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  45.09 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.09 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  47.11 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  47.11 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  47.27 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.57 
 
 		 338 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  44.85 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  42.38 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  43.16 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  43.54 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  41.32 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  41.28 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.99 
 
 		 346 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.24 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.46 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  42.15 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.56 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.85 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.17 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.94 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  43.33 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.54 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  40.85 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.87 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.32 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  39.32 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 308 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  43.38 
 
 		 314 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.72 
 
 		 343 aa  205  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.09 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.39 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  38.94 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.99 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.96 
 
 		 352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  38.1 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.77 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  39.56 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  42.72 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  39.56 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  38.2 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  43.73 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  39.69 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  35.14 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  34.42 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.02 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  32.62 
 
 		 319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.88 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  30.96 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.23 
 
 		 299 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  31.08 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  32.62 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  29.49 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  27.87 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  27.47 
 
 		 412 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.13 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.13 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.13 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  26.65 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.19 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.13 
 
 		 311 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.83 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  27.71 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.08 
 
 		 311 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.87 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.33 
 
 		 312 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.92 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  30.84 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.48 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  29.56 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  28.21 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.1 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.1 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  26.1 
 
 		 326 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  26.1 
 
 		 326 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  26.3 
 
 		 332 aa  86.3  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.1 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25.79 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.79 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>