More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4932 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  98.52 
 
 		 270 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  96.3 
 
 		 270 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  93.7 
 
 		 270 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  83.33 
 
 		 270 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  79.78 
 
 		 271 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  79.03 
 
 		 271 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  78.44 
 
 		 272 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  77.53 
 
 		 270 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  77.9 
 
 		 270 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  80.95 
 
 		 270 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  43.91 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  33.56 
 
 		 312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  40.1 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  38.65 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  37.68 
 
 		 329 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  35.89 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  30.63 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4912  aldo/keto reductase  33.45 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  39.75 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  30.56 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  30.9 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  37.33 
 
 		 331 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  34.08 
 
 		 332 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  31.06 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  32.11 
 
 		 330 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.72 
 
 		 323 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  34.27 
 
 		 330 aa  92.8  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  31.62 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  31.16 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  31.53 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  26.71 
 
 		 431 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  31.53 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  31.53 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  31.44 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  35.43 
 
 		 353 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  33.04 
 
 		 329 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  28.95 
 
 		 334 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  26.95 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  27.6 
 
 		 326 aa  90.1  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  35.43 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  31.22 
 
 		 306 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  32.75 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  36.2 
 
 		 349 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  35.12 
 
 		 341 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.34 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 348 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  31.56 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  33.33 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  27.8 
 
 		 339 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  30.1 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  32.59 
 
 		 368 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  29.7 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  28.42 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  33.04 
 
 		 343 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  30.23 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  29.49 
 
 		 350 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  31.51 
 
 		 322 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  32.88 
 
 		 311 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 328 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  29.07 
 
 		 323 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  31.77 
 
 		 343 aa  86.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  31.91 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  30 
 
 		 323 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  30.38 
 
 		 342 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  30.32 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  28.21 
 
 		 351 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.18 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  33.16 
 
 		 330 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 349 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  30.71 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  31.06 
 
 		 336 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  33.63 
 
 		 351 aa  85.9  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  34.38 
 
 		 343 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  28.94 
 
 		 340 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  38.04 
 
 		 354 aa  85.5  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  33.05 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  33.33 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  40 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  31.28 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  31.06 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  38.04 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  31.01 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.05 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  37.16 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  32.92 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.16 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  37.89 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.05 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  30.92 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1005  aldo/keto reductase  28.71 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  30.36 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.88 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  40.49 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  31.98 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  31.92 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>