More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0615 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  80.23 
 
 		 271 aa  434  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  80.23 
 
 		 270 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  78.11 
 
 		 272 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  80.23 
 
 		 270 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  80.23 
 
 		 270 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  78.71 
 
 		 271 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  79.85 
 
 		 270 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  78.41 
 
 		 270 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  76.4 
 
 		 270 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  76.78 
 
 		 270 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  42.17 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  31.88 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  38.05 
 
 		 327 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  30.94 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  37.63 
 
 		 330 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4912  aldo/keto reductase  33.1 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  39.51 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  29.43 
 
 		 431 aa  95.9  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  39.02 
 
 		 329 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  38.54 
 
 		 329 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  38.36 
 
 		 331 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1405  aldo/keto reductase  33.16 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910985  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  36.15 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  33.77 
 
 		 329 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  36.15 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  33.95 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  35.93 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  26.9 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  30.41 
 
 		 317 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  30.3 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  28.12 
 
 		 339 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  30.92 
 
 		 343 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.43 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  32.17 
 
 		 322 aa  89.4  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  32.44 
 
 		 332 aa  89.7  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  37.44 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  40.12 
 
 		 330 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.63 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  37.42 
 
 		 349 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  30.57 
 
 		 348 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  30.85 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  33.09 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  32.09 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 340 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.16 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  35.8 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  28.33 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  31.09 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.93 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  30.7 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  40.12 
 
 		 329 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  30.14 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  38.89 
 
 		 330 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  32.43 
 
 		 339 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  32.43 
 
 		 339 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  37.89 
 
 		 337 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  40.88 
 
 		 325 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  37.27 
 
 		 341 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  29.06 
 
 		 357 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  32.43 
 
 		 339 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3405  aldo/keto reductase  31.69 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  35.58 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  33.74 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.74 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  33.74 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  33.74 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  37.27 
 
 		 336 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  38.89 
 
 		 329 aa  85.9  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  30.23 
 
 		 328 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 327 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  33.13 
 
 		 304 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  36.45 
 
 		 314 aa  85.9  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  35.58 
 
 		 328 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  40 
 
 		 368 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  33.74 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  40 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.33 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  30.45 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  38.65 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  28.88 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  33.74 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  38.32 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  38.65 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  34.36 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.79 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1641  aldo/keto reductase  27.92 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.316031  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  31.6 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3195  aldo/keto reductase  35.58 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.51 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.51 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  34.97 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  34.08 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  38.89 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  36.76 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>