More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0534 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  100 
 
 
270 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  95.93 
 
 
270 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  93.7 
 
 
270 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  93.33 
 
 
270 aa  510  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  82.96 
 
 
270 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  78.28 
 
 
271 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  77.9 
 
 
271 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  78.07 
 
 
272 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  77.9 
 
 
270 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  80.95 
 
 
270 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  77.53 
 
 
270 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  43.91 
 
 
251 aa  175  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  33.45 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  38.65 
 
 
329 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  34.2 
 
 
327 aa  99  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  30.99 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  33.04 
 
 
329 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4912  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
298 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0730904  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  27.69 
 
 
431 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  34.98 
 
 
332 aa  95.9  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  36.71 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  36.23 
 
 
329 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  32.92 
 
 
330 aa  92.8  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  29.11 
 
 
339 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
335 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  38.65 
 
 
336 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  30 
 
 
317 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  30.68 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  31.16 
 
 
327 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  25.65 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  26.97 
 
 
339 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  35.76 
 
 
330 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  26.97 
 
 
339 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  26.97 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  36.81 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  33.8 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.64 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.18 
 
 
312 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  32.31 
 
 
326 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  36.2 
 
 
349 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  30.7 
 
 
328 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  35.24 
 
 
353 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  28.3 
 
 
340 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  30.34 
 
 
294 aa  85.9  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  31.22 
 
 
342 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
351 aa  85.5  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  35.29 
 
 
341 aa  85.5  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  34.86 
 
 
331 aa  85.5  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  35.75 
 
 
311 aa  85.5  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  27.87 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  31.94 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  34.11 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  36.02 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  29.83 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  31.6 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.91 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  30.04 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0341  aldo/keto reductase  29.72 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000752262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  32.22 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  29.17 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2227  aldo/keto reductase  35.05 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  unclonable  0.00000023844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  28.72 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  35.98 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  36.59 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  30.22 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1405  aldo/keto reductase  29.79 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  33.05 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  25.24 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  33.75 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  33.18 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  31.96 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  29.77 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  35.98 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  35.37 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.87 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  35.98 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.98 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.37 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  31.56 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  35.98 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.59 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  35.98 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  30.74 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.59 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  29.77 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  31.72 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  36.65 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.42 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  36.07 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0527  aldo/keto reductase  34.39 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.712224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  27.16 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  30.37 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  34.82 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  30.67 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>