More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0539 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  92.99 
 
 
271 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  84.64 
 
 
270 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  78.52 
 
 
272 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  79.03 
 
 
270 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  78.65 
 
 
270 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  78.65 
 
 
270 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  78.28 
 
 
270 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  77.15 
 
 
270 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  75.84 
 
 
270 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  78.57 
 
 
270 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
251 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  31.27 
 
 
312 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  32.5 
 
 
330 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  34.76 
 
 
341 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4912  aldo/keto reductase  31.47 
 
 
298 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0730904  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  38.1 
 
 
325 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
329 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  33.49 
 
 
337 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  29.64 
 
 
296 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  34.7 
 
 
339 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  34.7 
 
 
339 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  34.7 
 
 
339 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  32.56 
 
 
327 aa  98.6  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  30.87 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  29.97 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
336 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  36.57 
 
 
326 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  32.59 
 
 
343 aa  95.9  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  32.77 
 
 
336 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
326 aa  95.1  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  31.09 
 
 
280 aa  95.5  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  30.2 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  32.62 
 
 
349 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
335 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  32.49 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.84 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  32.77 
 
 
336 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0341  aldo/keto reductase  28.93 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000752262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.18 
 
 
335 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  33.79 
 
 
339 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  35.45 
 
 
314 aa  92.8  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  35.06 
 
 
338 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  30.34 
 
 
330 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  35.37 
 
 
431 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  35.35 
 
 
328 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  33.93 
 
 
368 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  32.44 
 
 
332 aa  92.4  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  33.48 
 
 
327 aa  92  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  31.63 
 
 
328 aa  92  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  29.94 
 
 
343 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  36.2 
 
 
349 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  37.44 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  34.25 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  32.72 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  32.62 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  32.09 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  32.62 
 
 
341 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
342 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  31.76 
 
 
342 aa  89.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  31.63 
 
 
328 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  39.29 
 
 
341 aa  89.7  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  29.3 
 
 
350 aa  89.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  36.12 
 
 
345 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.11 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  35.27 
 
 
340 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  35.27 
 
 
329 aa  89  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  33.62 
 
 
354 aa  89  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  33.62 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
343 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
351 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
325 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  32.62 
 
 
353 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  30.13 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.56 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  37.72 
 
 
368 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  33.64 
 
 
327 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  28.01 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  33.16 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1405  aldo/keto reductase  30.61 
 
 
326 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  34.16 
 
 
337 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2283  aldo/keto reductase  31.34 
 
 
357 aa  86.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0203552  normal  0.105124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1182  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
334 aa  86.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00764  putative oxidoreductase  28.67 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  29.66 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  32.89 
 
 
337 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.16 
 
 
311 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  32.39 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  32.59 
 
 
339 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  32.39 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  33.48 
 
 
334 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  30.49 
 
 
334 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  28.48 
 
 
341 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  39.02 
 
 
317 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  30.48 
 
 
323 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2301  aldo/keto reductase  39.29 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.92 
 
 
312 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>