More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1959 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  43.91 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  43.91 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  43.91 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  43.91 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.98 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  42.17 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  41.74 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  41.63 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  40.87 
 
 		 270 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  39.58 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  38.07 
 
 		 296 aa  96.3  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0341  aldo/keto reductase  40.99 
 
 		 296 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000752262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  31.35 
 
 		 431 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  34.95 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  29.9 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  32.46 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  32.43 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  31.25 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  39.53 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  40.16 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  32.26 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  27.8 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  32.46 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  35.71 
 
 		 341 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1041  aldo/keto reductase  37.4 
 
 		 329 aa  75.5  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  30.1 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  32.98 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  30.92 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  29.79 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  32.29 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  30.45 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  35.62 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  29.56 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  32.47 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.09 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  38.64 
 
 		 332 aa  72  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  33.58 
 
 		 306 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  29.26 
 
 		 329 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  36.59 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1022  aldo/keto reductase  38.19 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527199  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.39 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  35.71 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.27 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1895  aldo/keto reductase  30.05 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  37.17 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  38.1 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  34.85 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.71 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  33.71 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.85 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.71 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1108  aldo/keto reductase  34.38 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  39.26 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.77 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  35.4 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.71 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  36.3 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  36 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  33.08 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.08 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  33.08 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  36.29 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  33.08 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  34.13 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  39.68 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  31.52 
 
 		 329 aa  68.6  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  32.58 
 
 		 342 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  33.15 
 
 		 336 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.31 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  34.72 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  30.1 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  32.84 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  25.94 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  33.07 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  36.43 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.32 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  30.52 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  34.65 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  30.04 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  27.49 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  32.31 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  37.4 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  30.94 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  32.68 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  34.23 
 
 		 353 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  36.29 
 
 		 370 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  36.09 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  34.88 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  32.59 
 
 		 343 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  32.31 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  34.65 
 
 		 335 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  35.66 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1705  aldo/keto reductase  36.59 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  34.94 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>