More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1658 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  100 
 
 
370 aa  773    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  45.68 
 
 
370 aa  350  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  32.51 
 
 
337 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  36.29 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  37.02 
 
 
332 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  28.9 
 
 
340 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  28.35 
 
 
374 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  34.85 
 
 
280 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  28.83 
 
 
376 aa  143  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  33.21 
 
 
338 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  33.09 
 
 
338 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  30.29 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  32.71 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.14 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  29.12 
 
 
386 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  30.39 
 
 
283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  30.71 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  30.71 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  30.92 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.73 
 
 
350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  29.01 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  27.34 
 
 
376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  30 
 
 
311 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  29.95 
 
 
341 aa  126  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  32.82 
 
 
328 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  30.47 
 
 
343 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  27.06 
 
 
371 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  32.22 
 
 
345 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  32.44 
 
 
328 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  32.91 
 
 
351 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  25.9 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  27.69 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  28.64 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  28.89 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  27.51 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  26.55 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0658  aldo/keto reductase  37.43 
 
 
288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  27.05 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1410  aldo/keto reductase  39.18 
 
 
285 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  27.01 
 
 
386 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1705  aldo/keto reductase  38.01 
 
 
285 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  27.16 
 
 
371 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  25.84 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  30.8 
 
 
286 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  26.52 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  35.35 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  25.58 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  26.52 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  25.68 
 
 
381 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2293  aldo/keto reductase  32.86 
 
 
294 aa  109  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.253278  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  27.39 
 
 
413 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1306  aldo/keto reductase  31.64 
 
 
287 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.139902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  25.43 
 
 
400 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  27.54 
 
 
320 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1335  aldo/keto reductase  32.38 
 
 
294 aa  106  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  25.71 
 
 
396 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  25.5 
 
 
408 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.09 
 
 
382 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0769  Fe-S oxidoreductase  27.49 
 
 
379 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000125779 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  25.8 
 
 
377 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  25.45 
 
 
399 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  23.81 
 
 
365 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  26.05 
 
 
370 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  24.68 
 
 
401 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  25.3 
 
 
383 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0104  aldo/keto reductase  30.81 
 
 
294 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  25.51 
 
 
375 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2110  aldo/keto reductase  25.71 
 
 
396 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.797322  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  27.11 
 
 
400 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  26.34 
 
 
409 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  25.46 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  26.7 
 
 
379 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0202  aldo/keto reductase  30.54 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470074 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0206  aldo/keto reductase  30.54 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  25.55 
 
 
398 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  25.19 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  25.45 
 
 
409 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  24.43 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  25.45 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  23.79 
 
 
383 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4535  aldo/keto reductase  30.4 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0927734  decreased coverage  0.00892549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0272  aldo/keto reductase  24.94 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  24.94 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1747  hypothetical protein  33.78 
 
 
394 aa  93.2  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.482758  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1760  oxidoreductase  25.06 
 
 
373 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3239  aldo/keto reductase  32.02 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  25.73 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4324  aldo/keto reductase  29.49 
 
 
393 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3138  aldo/keto reductase  32.02 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0534  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  24 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  25.19 
 
 
381 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3300  aldo/keto reductase  28.28 
 
 
294 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0774  aldo/keto reductase  25.9 
 
 
315 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04651  aldo/keto reductase  22.37 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.205889  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  24.19 
 
 
397 aa  87.4  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2281  aldo/keto reductase  29.03 
 
 
312 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000892258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0341  aldo/keto reductase  31.16 
 
 
296 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000752262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3040  aldo/keto reductase  30.54 
 
 
313 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.292079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>