More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3049 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  100 
 
 
323 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  70.59 
 
 
323 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  65.94 
 
 
323 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  62.73 
 
 
323 aa  433  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0577  aldo/keto reductase  55.28 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  36.96 
 
 
329 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1255  putative oxidoreductase  46.92 
 
 
217 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0882151  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  33.78 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2769  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
329 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  33.92 
 
 
329 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  34.31 
 
 
331 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  36.36 
 
 
325 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  35.02 
 
 
328 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  35.39 
 
 
330 aa  165  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  35.19 
 
 
327 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  33.43 
 
 
328 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2079  aldo/keto reductase  33.78 
 
 
338 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  32.81 
 
 
325 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1344  aldo/keto reductase  32.09 
 
 
328 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  35.23 
 
 
327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  31.94 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1253  aldo/keto reductase  31.76 
 
 
328 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  35.67 
 
 
328 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  31.63 
 
 
327 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  32 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.66 
 
 
330 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  31.72 
 
 
330 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2005  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
339 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188789  normal  0.288175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  31.8 
 
 
327 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  32.47 
 
 
326 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  30.85 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  32.55 
 
 
328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  31.71 
 
 
317 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  30.35 
 
 
326 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.33 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  33.22 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.1 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1777  aldo/keto reductase  31.15 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.578556  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  33.11 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  28.65 
 
 
329 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3165  aldo/keto reductase  32.06 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
328 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  29.1 
 
 
332 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01130  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.97 
 
 
345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  28.82 
 
 
331 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  33.56 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  32.9 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  30.43 
 
 
311 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  27.44 
 
 
326 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  31.46 
 
 
327 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5178  aldo/keto reductase  32.65 
 
 
324 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  29.77 
 
 
326 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  31.35 
 
 
328 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  29.94 
 
 
333 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  31.08 
 
 
327 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  29.22 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
328 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  32.23 
 
 
328 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  32.26 
 
 
315 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  30.17 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  32.29 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  28.2 
 
 
312 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.26 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  34.54 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  28.19 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  28.35 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  29.23 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.84 
 
 
326 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  29.64 
 
 
330 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  30.6 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  30.6 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.6 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  30.79 
 
 
342 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  33.54 
 
 
330 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  28.92 
 
 
325 aa  116  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  30.56 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  31.23 
 
 
317 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  31.67 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  30.28 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.28 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  32.45 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  31 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  30.39 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
324 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  30.26 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  31.07 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  28.9 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.14 
 
 
334 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.28 
 
 
326 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  28.74 
 
 
339 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  29.65 
 
 
328 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  31.39 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  30.23 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  32.46 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  32.36 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>