More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3576 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  100 
 
 
323 aa  672    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  65.94 
 
 
323 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  61.92 
 
 
323 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  61.18 
 
 
323 aa  427  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0577  aldo/keto reductase  52.17 
 
 
323 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
329 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1255  putative oxidoreductase  47.39 
 
 
217 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0882151  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  32.48 
 
 
327 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2769  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  33.56 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
328 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  32.55 
 
 
328 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1344  aldo/keto reductase  31.65 
 
 
328 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  31.42 
 
 
328 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  32.82 
 
 
327 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2079  aldo/keto reductase  31.96 
 
 
338 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  31.48 
 
 
328 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1253  aldo/keto reductase  30.3 
 
 
328 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  29.12 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
325 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
309 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
330 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  32.28 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  31.46 
 
 
327 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  30.09 
 
 
329 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.79 
 
 
330 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  28.36 
 
 
329 aa  143  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  28.4 
 
 
327 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  32.66 
 
 
326 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  32.11 
 
 
325 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.85 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  29.64 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.29 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1777  aldo/keto reductase  29.34 
 
 
327 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.578556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  31.05 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  33.57 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  31.69 
 
 
326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  28.86 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  29.45 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  29.18 
 
 
326 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  30.7 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  33 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  31.08 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  32.68 
 
 
328 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  29.14 
 
 
332 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  32.13 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  32.68 
 
 
328 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  31.6 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  32.42 
 
 
317 aa  127  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2005  aldo/keto reductase  29.34 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188789  normal  0.288175 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  28.95 
 
 
331 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  31.37 
 
 
316 aa  125  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  29.55 
 
 
312 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01130  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.33 
 
 
345 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5178  aldo/keto reductase  28.75 
 
 
324 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  28.98 
 
 
319 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  28.98 
 
 
319 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  32.57 
 
 
328 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  30.03 
 
 
360 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  31.02 
 
 
342 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  30.49 
 
 
326 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  33.9 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  28.17 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  32.23 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  29.15 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  29.47 
 
 
329 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  30.19 
 
 
319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  29.7 
 
 
331 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  34.08 
 
 
329 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  29.53 
 
 
329 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  32.25 
 
 
331 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  32.04 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  27.95 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  29.22 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.94 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  30.94 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  28.99 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  31.19 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  30 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  29.87 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  28.66 
 
 
319 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  30.94 
 
 
330 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  31.49 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.49 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  29.04 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.49 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  31.99 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  31.76 
 
 
329 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  30.07 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  27.92 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.08 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  30.07 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2283  aldo/keto reductase  28.96 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0203552  normal  0.105124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  28.99 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  28.04 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>