More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5904 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  100 
 
 
317 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  73.9 
 
 
327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  75.31 
 
 
325 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  74.21 
 
 
325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  70.53 
 
 
327 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2079  aldo/keto reductase  72.64 
 
 
338 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1777  aldo/keto reductase  69.59 
 
 
327 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.578556  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  67.71 
 
 
330 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  68.03 
 
 
326 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  66.98 
 
 
330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  63.86 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  67.81 
 
 
328 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  62.26 
 
 
328 aa  391  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  64.26 
 
 
328 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  62.7 
 
 
331 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  65.62 
 
 
326 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0175  aldo/keto reductase  64.31 
 
 
309 aa  363  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0823113  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3165  aldo/keto reductase  60.82 
 
 
326 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  55.94 
 
 
328 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1253  aldo/keto reductase  59.11 
 
 
328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01130  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  55.22 
 
 
345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1344  aldo/keto reductase  57.83 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2005  aldo/keto reductase  53.54 
 
 
339 aa  318  7e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188789  normal  0.288175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  53.8 
 
 
331 aa  315  9e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  53.04 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  50.94 
 
 
329 aa  309  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
327 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  47.04 
 
 
328 aa  285  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  46.95 
 
 
326 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
328 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  48.1 
 
 
326 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  45.81 
 
 
325 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
326 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  45.12 
 
 
329 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
329 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  31.6 
 
 
323 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  37.95 
 
 
327 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  31.38 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  34.18 
 
 
330 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  30.38 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  31.67 
 
 
323 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  33.9 
 
 
319 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1711  aldo/keto reductase  32.81 
 
 
340 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1156  aldo/keto reductase  33.55 
 
 
331 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2698  aryl-alcohol dehydrogenase-related oxidoreductase  52.56 
 
 
225 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.2103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  32.37 
 
 
333 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1004  aldo/keto reductase  33.87 
 
 
331 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0837346  normal  0.566721 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  32.48 
 
 
323 aa  142  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  35.1 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  31.38 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  30.74 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  34.08 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  31.89 
 
 
319 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.61 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  30.63 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0759  aldo/keto reductase  36.82 
 
 
302 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  34.31 
 
 
318 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  31.05 
 
 
309 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.29 
 
 
308 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  34.41 
 
 
317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5178  aldo/keto reductase  32.79 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  31.53 
 
 
319 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  31.45 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  33.65 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  36.5 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  35.25 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  35.18 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  36.25 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  30.28 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  30.18 
 
 
330 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  33.89 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  36.43 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2283  aldo/keto reductase  32.5 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0203552  normal  0.105124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  32.19 
 
 
324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0577  aldo/keto reductase  29.26 
 
 
323 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1410  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  32.52 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3281  aldo/keto reductase  34.41 
 
 
351 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.27 
 
 
327 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  34.01 
 
 
309 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  31.33 
 
 
329 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  33.57 
 
 
332 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  30.67 
 
 
327 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  32.32 
 
 
328 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  35.79 
 
 
331 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  34.38 
 
 
327 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3557  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
335 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.729958  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.25 
 
 
311 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.54 
 
 
311 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  31.76 
 
 
317 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.69 
 
 
311 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  32.33 
 
 
325 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3670  aldo/keto reductase  35.69 
 
 
311 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.25 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  32.43 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3323  aldo/keto reductase  32.15 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.25 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>