More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1479 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  100 
 
 		 326 aa  676    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  48.77 
 
 		 326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  49.07 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  48.32 
 
 		 327 aa  322  8e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  44.92 
 
 		 329 aa  292  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  45.71 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  47.37 
 
 		 327 aa  288  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  44.17 
 
 		 330 aa  281  9e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.56 
 
 		 330 aa  278  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2079  aldo/keto reductase  44.9 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  45 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  43.89 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 325 aa  271  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  44.1 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259437 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  44.88 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  45.86 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2005  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188789  normal  0.288175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  48.1 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  42.72 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  43.67 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  43.83 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  43.84 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0175  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 309 aa  252  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0823113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3165  aldo/keto reductase  43.34 
 
 		 326 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  40.81 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1344  aldo/keto reductase  40.43 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  46.53 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1253  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1777  aldo/keto reductase  40.56 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.578556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  40.55 
 
 		 331 aa  242  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  38.39 
 
 		 329 aa  235  8e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01130  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.2 
 
 		 345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  33.44 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  30.18 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  33.12 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  29.9 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  32.62 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  28.4 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  34.38 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2283  aldo/keto reductase  31.03 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0203552  normal  0.105124 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  30.84 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  31.44 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  29.79 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  31.83 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  27.11 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1405  aldo/keto reductase  28.53 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  31.69 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  31.06 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3281  aldo/keto reductase  28.44 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  29.5 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0759  aldo/keto reductase  27.88 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  28.92 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  33.64 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  30.92 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  29.36 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  32.12 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  32.69 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0577  aldo/keto reductase  29.28 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.8 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1410  aldo/keto reductase  28.23 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  29.11 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.11 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  29.11 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  29.11 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  31.53 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  29.05 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1066  aldo/keto reductase  29.19 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.115194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1282  aldo/keto reductase  32.1 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.97 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  29.68 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  28.34 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  30.77 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  29.81 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.01 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  29.94 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1711  aldo/keto reductase  27.9 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  29.77 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0494  aldo/keto reductase  28.7 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.722341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.94 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  28.21 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.84 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  28.84 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.84 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  32.45 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  28.53 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  28.3 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  30.46 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  31.06 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1004  aldo/keto reductase  29.15 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0837346  normal  0.566721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  29.94 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2795  aldo/keto reductase  29.26 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  30.12 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  27.88 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  29.9 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>