More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2079 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2079  aldo/keto reductase  100 
 
 
338 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  78.15 
 
 
325 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  74.92 
 
 
327 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  75.38 
 
 
325 aa  471  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  69.42 
 
 
327 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  72.64 
 
 
317 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1777  aldo/keto reductase  67.89 
 
 
327 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.578556  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  62.5 
 
 
328 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  64.72 
 
 
326 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  62.42 
 
 
330 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  64.76 
 
 
330 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  63.64 
 
 
330 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  66.46 
 
 
328 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  63.41 
 
 
328 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  63.61 
 
 
326 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  58.61 
 
 
331 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0175  aldo/keto reductase  64.52 
 
 
309 aa  364  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0823113  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  57.93 
 
 
328 aa  361  9e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3165  aldo/keto reductase  61.77 
 
 
326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148665  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01130  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  56.98 
 
 
345 aa  350  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1253  aldo/keto reductase  58.23 
 
 
328 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  55.29 
 
 
331 aa  345  7e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  54.43 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1344  aldo/keto reductase  57.93 
 
 
328 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  53.5 
 
 
329 aa  339  4e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2005  aldo/keto reductase  52.65 
 
 
339 aa  324  2e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188789  normal  0.288175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
328 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  46.95 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
327 aa  306  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  45.34 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  44.9 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  49.25 
 
 
329 aa  268  8.999999999999999e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  43.21 
 
 
326 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  34.69 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  38.34 
 
 
329 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  32.05 
 
 
323 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  34.85 
 
 
330 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  35.69 
 
 
308 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  32.61 
 
 
323 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  35.69 
 
 
308 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  32.33 
 
 
332 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  34.94 
 
 
330 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  32.64 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  31.96 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  38.22 
 
 
327 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  32.31 
 
 
327 aa  159  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  34.41 
 
 
319 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  34.64 
 
 
318 aa  156  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  33.84 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2698  aryl-alcohol dehydrogenase-related oxidoreductase  54.14 
 
 
225 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.2103  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  33.66 
 
 
319 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0577  aldo/keto reductase  29.97 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  31.69 
 
 
312 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  33.97 
 
 
319 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1156  aldo/keto reductase  34.65 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  31.42 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  35.35 
 
 
327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  35.46 
 
 
317 aa  147  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  33.43 
 
 
319 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2283  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
357 aa  146  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0203552  normal  0.105124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  31.31 
 
 
329 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1410  aldo/keto reductase  34.14 
 
 
351 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  33.65 
 
 
319 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  32.71 
 
 
311 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1004  aldo/keto reductase  35.31 
 
 
331 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0837346  normal  0.566721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  34.1 
 
 
317 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  32.17 
 
 
330 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  34.73 
 
 
317 aa  143  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3281  aldo/keto reductase  34.44 
 
 
351 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  33.95 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1711  aldo/keto reductase  32.84 
 
 
340 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  34.23 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  32.83 
 
 
331 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5178  aldo/keto reductase  31.31 
 
 
324 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
328 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  36.13 
 
 
317 aa  139  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1066  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
364 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.115194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  33.75 
 
 
328 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  33.22 
 
 
316 aa  136  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  31.97 
 
 
330 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  32.73 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  34.74 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  34.43 
 
 
326 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  29.28 
 
 
311 aa  135  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  34.74 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  35.05 
 
 
322 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
340 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0759  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
302 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
316 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
324 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  33.87 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  34.27 
 
 
328 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.34 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  34.81 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  34.81 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.75 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  33.72 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>