More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0759 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0759  aldo/keto reductase  100 
 
 
302 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  36.27 
 
 
330 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  35.22 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  32.55 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  37.37 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  27.88 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  29.97 
 
 
326 aa  132  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  30.1 
 
 
326 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  31.51 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2079  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0175  aldo/keto reductase  36.43 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0823113  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  32.27 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  33.76 
 
 
330 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  32.9 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  32.33 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  34.35 
 
 
325 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  32.48 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  32.79 
 
 
328 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  34.24 
 
 
327 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  30.74 
 
 
327 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  34.11 
 
 
329 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  36.55 
 
 
326 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  32.9 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  31.03 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3165  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  29.47 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  30.65 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  34.84 
 
 
328 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  32.8 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  31.27 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  32.36 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  35.06 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  30.99 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  28.12 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1253  aldo/keto reductase  30.43 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.41 
 
 
311 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.41 
 
 
311 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.41 
 
 
311 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  33.56 
 
 
329 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  31.85 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.41 
 
 
311 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
331 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  32.89 
 
 
349 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.08 
 
 
311 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  29.81 
 
 
327 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2005  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
339 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188789  normal  0.288175 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
309 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.58 
 
 
332 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  30.51 
 
 
324 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  32.21 
 
 
309 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  32.78 
 
 
329 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  29.25 
 
 
331 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
327 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.22 
 
 
308 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  28.3 
 
 
331 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1777  aldo/keto reductase  32.5 
 
 
327 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.578556  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  31.58 
 
 
332 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  32.38 
 
 
325 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.19 
 
 
311 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.45 
 
 
311 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  29.34 
 
 
317 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.48 
 
 
311 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  26.47 
 
 
319 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.59 
 
 
308 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  30.92 
 
 
370 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1344  aldo/keto reductase  28.76 
 
 
328 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
351 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.11 
 
 
311 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
329 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  29.45 
 
 
311 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  26.73 
 
 
329 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1282  aldo/keto reductase  34.18 
 
 
346 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  30.32 
 
 
322 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  31.68 
 
 
327 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  29.97 
 
 
317 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0494  aldo/keto reductase  29.28 
 
 
315 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.722341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01130  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  33.77 
 
 
345 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  30.59 
 
 
351 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  30.59 
 
 
351 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
315 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  30.26 
 
 
351 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  26.8 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  25.66 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  32 
 
 
332 aa  99.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  33.78 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  28.08 
 
 
311 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  29.39 
 
 
344 aa  99.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  32.56 
 
 
343 aa  99.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  27.15 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  28.48 
 
 
319 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  32.12 
 
 
341 aa  99  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  31.33 
 
 
343 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  34.04 
 
 
327 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.06 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
347 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  31.86 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  31.1 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  30.87 
 
 
316 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>