More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0748 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  100 
 
 
329 aa  670    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1711  aldo/keto reductase  50.6 
 
 
340 aa  318  7.999999999999999e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  44.97 
 
 
332 aa  300  3e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2283  aldo/keto reductase  43.64 
 
 
357 aa  282  5.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0203552  normal  0.105124 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1410  aldo/keto reductase  44.17 
 
 
351 aa  272  7e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3281  aldo/keto reductase  44.79 
 
 
351 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1066  aldo/keto reductase  40.29 
 
 
364 aa  260  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.115194 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1405  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
326 aa  247  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910985  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2227  aldo/keto reductase  39.67 
 
 
322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  unclonable  0.00000023844 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0494  aldo/keto reductase  36.06 
 
 
315 aa  182  7e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.722341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  36.48 
 
 
309 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  32.93 
 
 
325 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  34.59 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  34.28 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0241  aldo/keto reductase  38.22 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1654  aldo/keto reductase  37.58 
 
 
305 aa  162  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.306756 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1165  aldo/keto reductase  35.51 
 
 
298 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000366961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  32.25 
 
 
312 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  32.13 
 
 
328 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.02 
 
 
330 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  31 
 
 
327 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  32.6 
 
 
328 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
327 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  31 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  27.93 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  31.99 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  27.05 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  34.28 
 
 
306 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  29.9 
 
 
326 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  31.03 
 
 
328 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  31.61 
 
 
325 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  28.92 
 
 
327 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  30.7 
 
 
327 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  30.47 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  32.57 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1777  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.578556  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  32.91 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  30.49 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  27.36 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2079  aldo/keto reductase  30.7 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1344  aldo/keto reductase  29.53 
 
 
328 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  29.79 
 
 
326 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  31.65 
 
 
326 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  31.16 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  29.18 
 
 
328 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  30.7 
 
 
330 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1253  aldo/keto reductase  28.85 
 
 
328 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  32.56 
 
 
330 aa  135  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  30.28 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  32.51 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  26.51 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 
329 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  28.7 
 
 
330 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  30.22 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  30.25 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  29.45 
 
 
304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  30.52 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  30.92 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  30.43 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  31.76 
 
 
325 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0175  aldo/keto reductase  29.62 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0823113  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
324 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  29.45 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1156  aldo/keto reductase  31.8 
 
 
331 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  30.49 
 
 
304 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.49 
 
 
304 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.57 
 
 
304 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  30.49 
 
 
304 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  30.49 
 
 
324 aa  129  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  30.72 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  30.87 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  30.79 
 
 
327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  29.5 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2472  aldo/keto reductase  28.88 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  32.03 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2005  aldo/keto reductase  28.61 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188789  normal  0.288175 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  29.32 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5178  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
324 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.26 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.26 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  28.35 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  30.26 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  28.4 
 
 
326 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  30.22 
 
 
331 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  32.25 
 
 
316 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  29.88 
 
 
304 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  30.03 
 
 
315 aa  125  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3165  aldo/keto reductase  27.83 
 
 
326 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148665  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  29.54 
 
 
311 aa  125  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  28.81 
 
 
329 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  29.47 
 
 
327 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1949  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
330 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.876461  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  31.01 
 
 
328 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  30.23 
 
 
304 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  32.45 
 
 
343 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.43 
 
 
327 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  30.16 
 
 
334 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4260  aldo/keto reductase  30.7 
 
 
327 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  30.91 
 
 
327 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>