More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3323 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3323  aldo/keto reductase  100 
 
 
335 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3557  aldo/keto reductase  90.15 
 
 
335 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.729958  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  50 
 
 
330 aa  311  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1156  aldo/keto reductase  50.79 
 
 
331 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1004  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
331 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0837346  normal  0.566721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1282  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
346 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
340 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  37.06 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  34.43 
 
 
331 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  38.34 
 
 
331 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  35.53 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  35.69 
 
 
342 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  34.59 
 
 
308 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  34.42 
 
 
324 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  35.11 
 
 
326 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  34.97 
 
 
319 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  34.29 
 
 
331 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  33.76 
 
 
324 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  35.24 
 
 
331 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  36.36 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  33.13 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  33.64 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  34.97 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  36.3 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  33.65 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  36.04 
 
 
328 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
309 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  34.87 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  37.38 
 
 
331 aa  146  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  35.06 
 
 
331 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
329 aa  146  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.88 
 
 
329 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  33.88 
 
 
329 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.88 
 
 
329 aa  146  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  36.69 
 
 
401 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  33.74 
 
 
331 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.75 
 
 
325 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.12 
 
 
331 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  34.73 
 
 
331 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
326 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  35.28 
 
 
325 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2093  aldo/keto reductase  34.5 
 
 
322 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461089  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  35.67 
 
 
331 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  35.69 
 
 
334 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  33.66 
 
 
330 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  34.52 
 
 
329 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  34.41 
 
 
327 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  33.84 
 
 
331 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  34.74 
 
 
329 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  35.38 
 
 
335 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  33.88 
 
 
329 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  33.74 
 
 
330 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  33.87 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  33.64 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
327 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  37.25 
 
 
328 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  35.06 
 
 
329 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  34.63 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  33.53 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  32.36 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  31.19 
 
 
331 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  35.06 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.04 
 
 
327 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  33.99 
 
 
328 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  32.1 
 
 
331 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  35.33 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  34.2 
 
 
330 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  35.45 
 
 
325 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
328 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  34.84 
 
 
332 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  36.06 
 
 
330 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  33.96 
 
 
325 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  34.64 
 
 
327 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.01 
 
 
329 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  35.76 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  34.91 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  35.48 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  33.66 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  32.7 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2472  aldo/keto reductase  33.84 
 
 
329 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  33.22 
 
 
330 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  35.76 
 
 
327 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  33.65 
 
 
321 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3244  aldo/keto reductase  32.94 
 
 
329 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667963  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  32.57 
 
 
329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1949  aldo/keto reductase  35.02 
 
 
330 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.876461  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  37 
 
 
325 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.23 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  35.28 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  35.18 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  31.94 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  35.35 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  33.66 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  34.75 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  32.58 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2757  aldo/keto reductase  32.27 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0729923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  32.42 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>