120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0785 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0333  diguanylate phosphodiesterase  99.63 
 
 		 267 aa  540  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0816  diguanylate phosphodiesterase  99.63 
 
 		 267 aa  540  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0785  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0713  diguanylate phosphodiesterase  97.38 
 
 		 267 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.368444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0697  diguanylate phosphodiesterase  97.38 
 
 		 281 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3909  diguanylate phosphodiesterase  95.51 
 
 		 267 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2567  diguanylate phosphodiesterase  95.11 
 
 		 281 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1393  EAL domain-containing protein  80.68 
 
 		 322 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2061  EAL domain-containing protein  81.06 
 
 		 306 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3233  EAL domain-containing protein  81.06 
 
 		 306 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0850  cyclic diguanylate phosphodiesterase  81.06 
 
 		 268 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2682  cyclic diguanylate phosphodiesterase  81.06 
 
 		 268 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3179  FOG EAL domain-containing protein  81.06 
 
 		 268 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3218  cyclic diguanylate phosphodiesterase  81.06 
 
 		 268 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1927  cyclic diguanylate phosphodiesterase  81.06 
 
 		 268 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0778  putative diguanylate phosphodiesterase  64.31 
 
 		 289 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3902  diguanylate phosphodiesterase  63.2 
 
 		 303 aa  325  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2436  putative diguanylate phosphodiesterase  61.34 
 
 		 290 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1972  hypothetical protein  34.5 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1374  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1282  diguanylate phosphodiesterase  31.56 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.080295  normal  0.395871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1219  diguanylate phosphodiesterase  31.11 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.223497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1343  hypothetical protein  30.22 
 
 		 301 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.358425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0506  diguanylate phosphodiesterase  28.44 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4127  EAL  37.5 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0898  hypothetical protein  33.11 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  26.88 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  24.6 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  28.98 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  24.9 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  24.9 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  26.59 
 
 		 440 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  24.9 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  26.29 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  24.9 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  24.9 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  28.03 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.77 
 
 		 786 aa  56.2  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  25.95 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  26.32 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  25.99 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  26.59 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  26.51 
 
 		 428 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  26.51 
 
 		 428 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  26.51 
 
 		 428 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  26.25 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  26.25 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  23.39 
 
 		 428 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  28.22 
 
 		 426 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  28.33 
 
 		 426 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  24.47 
 
 		 424 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  25 
 
 		 409 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.8 
 
 		 580 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  23.75 
 
 		 584 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  24.81 
 
 		 427 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  24.05 
 
 		 422 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  25.71 
 
 		 464 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  24.05 
 
 		 422 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  24.05 
 
 		 424 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  25.71 
 
 		 464 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.49 
 
 		 572 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  25.71 
 
 		 515 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  26.83 
 
 		 429 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  25.2 
 
 		 423 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  26.18 
 
 		 424 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  26.18 
 
 		 422 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  26.18 
 
 		 422 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.41 
 
 		 605 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  26.42 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  28.08 
 
 		 428 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.2 
 
 		 632 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  25.41 
 
 		 413 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  26.42 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  28.08 
 
 		 428 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  28.98 
 
 		 416 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  28.1 
 
 		 423 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  25.91 
 
 		 424 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.67 
 
 		 583 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  24.59 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.67 
 
 		 583 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  30.61 
 
 		 533 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.67 
 
 		 584 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.61 
 
 		 533 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.61 
 
 		 533 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.67 
 
 		 585 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.67 
 
 		 585 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.67 
 
 		 585 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.61 
 
 		 474 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  30.61 
 
 		 460 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  23.67 
 
 		 584 aa  48.9  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.67 
 
 		 584 aa  48.9  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  25.39 
 
 		 424 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.15 
 
 		 581 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  25.39 
 
 		 424 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.67 
 
 		 585 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  25.39 
 
 		 424 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  25.81 
 
 		 424 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.01 
 
 		 596 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  24.87 
 
 		 424 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>