105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1393 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1393  EAL domain-containing protein  100 
 
 
322 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2061  EAL domain-containing protein  96.6 
 
 
306 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3233  EAL domain-containing protein  96.6 
 
 
306 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0850  cyclic diguanylate phosphodiesterase  96.64 
 
 
268 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2682  cyclic diguanylate phosphodiesterase  96.64 
 
 
268 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3179  FOG EAL domain-containing protein  96.64 
 
 
268 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3218  cyclic diguanylate phosphodiesterase  96.64 
 
 
268 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1927  cyclic diguanylate phosphodiesterase  96.64 
 
 
268 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475709  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0697  diguanylate phosphodiesterase  79.5 
 
 
281 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2567  diguanylate phosphodiesterase  77.74 
 
 
281 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412974  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3909  diguanylate phosphodiesterase  80.68 
 
 
267 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0333  diguanylate phosphodiesterase  80.68 
 
 
267 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0816  diguanylate phosphodiesterase  80.68 
 
 
267 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0785  diguanylate phosphodiesterase  80.68 
 
 
267 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0713  diguanylate phosphodiesterase  79.92 
 
 
267 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.368444  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0778  putative diguanylate phosphodiesterase  64.56 
 
 
289 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3902  diguanylate phosphodiesterase  62.93 
 
 
303 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2436  putative diguanylate phosphodiesterase  65.06 
 
 
290 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137812  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1282  diguanylate phosphodiesterase  32.91 
 
 
294 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.080295  normal  0.395871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1219  diguanylate phosphodiesterase  32.49 
 
 
294 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.223497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1374  diguanylate phosphodiesterase  32.34 
 
 
275 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1343  hypothetical protein  30.86 
 
 
301 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.358425  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1972  hypothetical protein  32.03 
 
 
280 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0506  diguanylate phosphodiesterase  26.78 
 
 
297 aa  89.4  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4127  EAL  32.57 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0898  hypothetical protein  34.46 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  28.94 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.77 
 
 
786 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  27.16 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  27.16 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.5 
 
 
773 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  28.71 
 
 
427 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  25.69 
 
 
426 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  25.61 
 
 
426 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  25.61 
 
 
426 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  28.71 
 
 
403 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  28.71 
 
 
403 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  27.82 
 
 
428 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  33.9 
 
 
197 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  26.92 
 
 
428 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  26.92 
 
 
428 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  24.8 
 
 
447 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  26.92 
 
 
428 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  27.76 
 
 
429 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  28.71 
 
 
482 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  25.19 
 
 
424 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  28.71 
 
 
474 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  27.31 
 
 
428 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  28.71 
 
 
474 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  27.31 
 
 
428 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.71 
 
 
632 aa  59.7  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  25.71 
 
 
440 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  27 
 
 
515 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27 
 
 
464 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27 
 
 
464 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  27.69 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.39 
 
 
581 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  24.69 
 
 
423 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  27.27 
 
 
424 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  25.2 
 
 
409 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  29.52 
 
 
416 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  27.27 
 
 
422 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27.27 
 
 
422 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  27.38 
 
 
262 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  26.1 
 
 
446 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  23.11 
 
 
413 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  23.94 
 
 
428 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  28.42 
 
 
424 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  28.42 
 
 
422 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  28.42 
 
 
422 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  27 
 
 
424 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  27 
 
 
424 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.98 
 
 
572 aa  52.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  27.69 
 
 
423 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  27.83 
 
 
427 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  26.58 
 
 
424 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  26.58 
 
 
424 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  27 
 
 
424 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  26.58 
 
 
424 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.5 
 
 
596 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  25.74 
 
 
424 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  26.42 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.99 
 
 
584 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  27 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  27.4 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  26.05 
 
 
424 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1762  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.63 
 
 
1032 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 
254 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.46 
 
 
605 aa  46.6  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  26.57 
 
 
582 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  26.94 
 
 
379 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.31 
 
 
611 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  26.94 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  26.58 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.05 
 
 
790 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  26.57 
 
 
601 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  24.22 
 
 
427 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  26.57 
 
 
592 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  26.34 
 
 
425 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>