75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3902 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3902  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0778  putative diguanylate phosphodiesterase  92.33 
 
 		 289 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2436  putative diguanylate phosphodiesterase  75.64 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1393  EAL domain-containing protein  62.93 
 
 		 322 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2061  EAL domain-containing protein  62.59 
 
 		 306 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3233  EAL domain-containing protein  62.59 
 
 		 306 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3179  FOG EAL domain-containing protein  65.56 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0850  cyclic diguanylate phosphodiesterase  65.56 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3218  cyclic diguanylate phosphodiesterase  65.56 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1927  cyclic diguanylate phosphodiesterase  65.56 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2682  cyclic diguanylate phosphodiesterase  65.56 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0785  diguanylate phosphodiesterase  63.2 
 
 		 267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0816  diguanylate phosphodiesterase  62.83 
 
 		 267 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0333  diguanylate phosphodiesterase  62.83 
 
 		 267 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2567  diguanylate phosphodiesterase  61.35 
 
 		 281 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0697  diguanylate phosphodiesterase  60.56 
 
 		 281 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0713  diguanylate phosphodiesterase  62.45 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.368444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3909  diguanylate phosphodiesterase  62.83 
 
 		 267 aa  318  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1972  hypothetical protein  36.47 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1374  diguanylate phosphodiesterase  35.88 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1282  diguanylate phosphodiesterase  31.79 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.080295  normal  0.395871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0506  diguanylate phosphodiesterase  27.92 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1219  diguanylate phosphodiesterase  30.04 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.223497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1343  hypothetical protein  31.76 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.358425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4127  EAL  31.14 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0898  hypothetical protein  40.4 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  26.51 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  28.29 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  32.8 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  26 
 
 		 413 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  27.27 
 
 		 426 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  28.26 
 
 		 426 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  27.27 
 
 		 426 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.1 
 
 		 786 aa  48.9  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  27.72 
 
 		 447 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  24.7 
 
 		 403 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  24.7 
 
 		 427 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  24.7 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.21 
 
 		 580 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  27.27 
 
 		 426 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  27.48 
 
 		 424 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  24.6 
 
 		 482 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.94 
 
 		 581 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  24.6 
 
 		 474 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  24.6 
 
 		 474 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  27.05 
 
 		 426 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  22.89 
 
 		 440 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  28.67 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.88 
 
 		 632 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  26.75 
 
 		 424 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.71 
 
 		 599 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  26.75 
 
 		 424 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  26.75 
 
 		 424 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  25.51 
 
 		 428 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.48 
 
 		 572 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  26.75 
 
 		 424 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  28 
 
 		 424 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  29.52 
 
 		 428 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  23.46 
 
 		 446 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  27.33 
 
 		 424 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  26.11 
 
 		 424 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  25.62 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27.33 
 
 		 422 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  27.33 
 
 		 422 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  30.54 
 
 		 428 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  27.33 
 
 		 424 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  30.54 
 
 		 428 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  30.54 
 
 		 428 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  27.33 
 
 		 424 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.41 
 
 		 583 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.15 
 
 		 766 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.41 
 
 		 583 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  25.3 
 
 		 427 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  30.25 
 
 		 428 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.41 
 
 		 584 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>