106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1927 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2061  EAL domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3233  EAL domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0850  cyclic diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2682  cyclic diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3179  FOG EAL domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3218  cyclic diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1927  cyclic diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1393  EAL domain-containing protein  96.64 
 
 		 322 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3909  diguanylate phosphodiesterase  81.06 
 
 		 267 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0333  diguanylate phosphodiesterase  81.06 
 
 		 267 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0816  diguanylate phosphodiesterase  81.06 
 
 		 267 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2567  diguanylate phosphodiesterase  80.6 
 
 		 281 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0785  diguanylate phosphodiesterase  81.06 
 
 		 267 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0713  diguanylate phosphodiesterase  80.3 
 
 		 267 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.368444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0697  diguanylate phosphodiesterase  80.3 
 
 		 281 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0778  putative diguanylate phosphodiesterase  66.3 
 
 		 289 aa  349  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3902  diguanylate phosphodiesterase  65.56 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2436  putative diguanylate phosphodiesterase  65.06 
 
 		 290 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1282  diguanylate phosphodiesterase  32.44 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.080295  normal  0.395871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1219  diguanylate phosphodiesterase  32 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.223497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1374  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1972  hypothetical protein  31.53 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1343  hypothetical protein  30.74 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.358425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0506  diguanylate phosphodiesterase  26.38 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4127  EAL  33.14 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0898  hypothetical protein  31.41 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  30.17 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  30.17 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  30.17 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  30.17 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  29.13 
 
 		 428 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  29.13 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  25.5 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  25.88 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  27.35 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  25.51 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  25.51 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  27.16 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  27.67 
 
 		 419 aa  62.4  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  25.09 
 
 		 440 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  26.32 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  33.05 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  27.76 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  28.02 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  25.41 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  25.41 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  25.51 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  25.51 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  25.51 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.3 
 
 		 786 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  25.09 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27 
 
 		 464 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  27 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.56 
 
 		 632 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  29.07 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  29.92 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  26.23 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  27.27 
 
 		 424 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  26.45 
 
 		 422 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  26.45 
 
 		 422 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  26.45 
 
 		 424 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.38 
 
 		 581 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  24.32 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  23.32 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  24.9 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  27.87 
 
 		 424 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27.87 
 
 		 422 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27.87 
 
 		 422 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  26.58 
 
 		 424 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  26.58 
 
 		 424 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  24.23 
 
 		 427 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  26.58 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  27.17 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.54 
 
 		 596 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  26.83 
 
 		 367 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  25.74 
 
 		 424 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  25.74 
 
 		 424 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  25.74 
 
 		 424 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  25.32 
 
 		 424 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  26.58 
 
 		 436 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.02 
 
 		 584 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  26.94 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  26.83 
 
 		 425 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1762  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.57 
 
 		 1032 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  27.08 
 
 		 592 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.1 
 
 		 605 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  25.3 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  26.42 
 
 		 422 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.92 
 
 		 611 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  26.42 
 
 		 379 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  26.55 
 
 		 601 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  25.1 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  26.55 
 
 		 582 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  26.16 
 
 		 436 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.68 
 
 		 790 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  25.65 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.8 
 
 		 565 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 411 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>