161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4127 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4127  EAL  100 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0898  hypothetical protein  31.85 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0506  diguanylate phosphodiesterase  32.13 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1282  diguanylate phosphodiesterase  27.57 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.080295  normal  0.395871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  29.24 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  28.89 
 
 		 428 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2061  EAL domain-containing protein  33.14 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1972  hypothetical protein  30.47 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3233  EAL domain-containing protein  33.14 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  31.55 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0850  cyclic diguanylate phosphodiesterase  33.14 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2682  cyclic diguanylate phosphodiesterase  33.14 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3179  FOG EAL domain-containing protein  33.14 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3218  cyclic diguanylate phosphodiesterase  33.14 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1927  cyclic diguanylate phosphodiesterase  33.14 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1393  EAL domain-containing protein  32.57 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1219  diguanylate phosphodiesterase  27.24 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.223497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  32.74 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  30.94 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1343  hypothetical protein  27.6 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.358425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1374  diguanylate phosphodiesterase  28.38 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  28.39 
 
 		 426 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2567  diguanylate phosphodiesterase  31.4 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0785  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0333  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0816  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  28.76 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  31.25 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  28.33 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  28.33 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  28.88 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  29.83 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0713  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.368444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  29.83 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  29.83 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  29.83 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  29.83 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.69 
 
 		 786 aa  69.3  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  29.83 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0697  diguanylate phosphodiesterase  31.4 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  28.33 
 
 		 482 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 464 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  28.33 
 
 		 474 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3909  diguanylate phosphodiesterase  36.67 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  28.33 
 
 		 474 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.55 
 
 		 777 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  30.08 
 
 		 515 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  30.08 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0778  putative diguanylate phosphodiesterase  27.97 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  30.49 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  30.49 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  26.1 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  27.2 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  25.82 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  30.51 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  26.1 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  26.1 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  26.1 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  29.11 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3902  diguanylate phosphodiesterase  31.14 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2436  putative diguanylate phosphodiesterase  27.96 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27 
 
 		 790 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  25.7 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  25.97 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  29.96 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  25.7 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  25.3 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  23.21 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  26.13 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  26.36 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  25.4 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  25.4 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  25.4 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  25.4 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  29.54 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  25 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  23.81 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  28.76 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  25.52 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  27.44 
 
 		 440 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  21.98 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  21.67 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.17 
 
 		 766 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.22 
 
 		 753 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  24.58 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  25.32 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  22.59 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  22.59 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2208  diguanylate phosphodiesterase  26.27 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.89 
 
 		 780 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  26.52 
 
 		 411 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  24.89 
 
 		 441 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  21.94 
 
 		 413 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.24 
 
 		 611 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  26.34 
 
 		 475 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  25.89 
 
 		 590 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.75 
 
 		 883 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>