124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4650 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  100 
 
 
356 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  89.61 
 
 
356 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  100 
 
 
356 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  99.72 
 
 
356 aa  710    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  90.17 
 
 
356 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  92.98 
 
 
356 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  84.83 
 
 
356 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  73.95 
 
 
357 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  73.95 
 
 
357 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  73.95 
 
 
357 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  73.67 
 
 
357 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  73.95 
 
 
357 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  73.95 
 
 
357 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  73.67 
 
 
357 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  73.67 
 
 
357 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  58.33 
 
 
345 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  53.07 
 
 
358 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  53.63 
 
 
358 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  57.02 
 
 
361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  54.64 
 
 
356 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  54.64 
 
 
356 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  51.17 
 
 
362 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  50 
 
 
374 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  49.28 
 
 
374 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  47.44 
 
 
398 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  55.91 
 
 
339 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  33.1 
 
 
403 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  28.01 
 
 
411 aa  150  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  41.08 
 
 
444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  29.36 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  30.51 
 
 
352 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  30.51 
 
 
352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  30.51 
 
 
352 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  30.51 
 
 
352 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  28.66 
 
 
352 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  30.51 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  28.34 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  28.34 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  28.34 
 
 
352 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  28.34 
 
 
352 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  28.34 
 
 
352 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  28.34 
 
 
352 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  31.54 
 
 
388 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  28.34 
 
 
352 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  29.39 
 
 
352 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  34.27 
 
 
226 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  27.11 
 
 
372 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  27.11 
 
 
372 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  26.76 
 
 
372 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  26.76 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  30.56 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  29.63 
 
 
389 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  29.63 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  29.63 
 
 
380 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  29.63 
 
 
388 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  27.98 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  24.91 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  31.68 
 
 
644 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.92 
 
 
651 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.92 
 
 
651 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.92 
 
 
651 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  26.97 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.41 
 
 
700 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  32.41 
 
 
700 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25.44 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  31.18 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  26.4 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.03 
 
 
655 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.5 
 
 
719 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.41 
 
 
724 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  32.7 
 
 
363 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.1 
 
 
699 aa  50.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25 
 
 
662 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.29 
 
 
672 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4390  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.36 
 
 
655 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.81 
 
 
662 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.44 
 
 
699 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  29.29 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  26.5 
 
 
764 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  27.59 
 
 
718 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  25.87 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.7 
 
 
653 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3667  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.35 
 
 
651 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  27.81 
 
 
708 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  33.1 
 
 
676 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.67 
 
 
670 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  26.2 
 
 
725 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>