127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1057 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  99.72 
 
 
357 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  99.72 
 
 
357 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  91.88 
 
 
357 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  99.72 
 
 
357 aa  716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  99.72 
 
 
357 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  99.72 
 
 
357 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  73.67 
 
 
356 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  73.95 
 
 
356 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  70.95 
 
 
356 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  73.67 
 
 
356 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  73.67 
 
 
356 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  73.67 
 
 
356 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  74.64 
 
 
356 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  59.54 
 
 
345 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  53.48 
 
 
358 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  52.51 
 
 
358 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  57.71 
 
 
361 aa  362  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  58.02 
 
 
356 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  58.02 
 
 
356 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  51 
 
 
374 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  52.19 
 
 
362 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  50.28 
 
 
374 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  49.43 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  45.75 
 
 
339 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  31.13 
 
 
403 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  38.32 
 
 
444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  28.97 
 
 
411 aa  150  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  29.97 
 
 
355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  29.31 
 
 
352 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  29.31 
 
 
352 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  29.31 
 
 
352 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  29.31 
 
 
352 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  29.31 
 
 
352 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  27.99 
 
 
352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  28.61 
 
 
352 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  28.33 
 
 
352 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  28.33 
 
 
352 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  28.33 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  28.33 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  28.33 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  29.07 
 
 
352 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  31.02 
 
 
388 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  34.48 
 
 
226 aa  106  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  26.51 
 
 
354 aa  99.8  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  27.87 
 
 
389 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  27.87 
 
 
389 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  27.87 
 
 
380 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  27.87 
 
 
388 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  25.5 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  26.32 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  26.67 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  26.67 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  29.3 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  30.88 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  33.54 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.35 
 
 
724 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  30.81 
 
 
361 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  25.78 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  26.22 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  29.35 
 
 
740 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  27.49 
 
 
395 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  25.64 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  25.64 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.88 
 
 
651 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.88 
 
 
651 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.03 
 
 
738 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.88 
 
 
651 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.03 
 
 
738 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  26.4 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  25.58 
 
 
770 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  36.84 
 
 
764 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  26.7 
 
 
708 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  28.07 
 
 
728 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  27.11 
 
 
731 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  25.63 
 
 
638 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  27.11 
 
 
731 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  32.52 
 
 
655 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  24.81 
 
 
725 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  25.22 
 
 
790 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  24.81 
 
 
725 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.08 
 
 
699 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  26.32 
 
 
729 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  25.86 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.59 
 
 
695 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  28 
 
 
700 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  30.06 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  24.36 
 
 
733 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.59 
 
 
695 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.92 
 
 
763 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  26.2 
 
 
725 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  30.59 
 
 
695 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  30.59 
 
 
695 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  27.93 
 
 
732 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.78 
 
 
720 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  30 
 
 
695 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  32.52 
 
 
655 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  27.49 
 
 
638 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.121215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>