180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4389 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  79.71 
 
 		 363 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  42.81 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  40.51 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  40.61 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  39.52 
 
 		 378 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0145  hypothetical protein  39.94 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0706  hypothetical protein  38.48 
 
 		 373 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  38.51 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  33.7 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  33.01 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  29.57 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  32.12 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  29.66 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4804  membrane protein-like protein  40 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  26.99 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.14 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.14 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  24.14 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  24.14 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  25.41 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.79 
 
 		 695 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  28.99 
 
 		 653 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2537  integral membrane protein  21.76 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000042014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  37.8 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.15 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.78 
 
 		 691 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  26.11 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  26.11 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  26.11 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  26.11 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  30.82 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.21 
 
 		 653 aa  57  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.85 
 
 		 696 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.85 
 
 		 696 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.85 
 
 		 696 aa  56.6  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.85 
 
 		 696 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.85 
 
 		 696 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.85 
 
 		 696 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  22.85 
 
 		 700 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  22.85 
 
 		 700 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  37.01 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  37.01 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2513  hypothetical protein  26.67 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2478  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000608339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2557  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000442188  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  31.66 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  28.49 
 
 		 729 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  31.66 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2743  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484045  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  31.84 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  27.03 
 
 		 700 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  25.66 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  31.66 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  30.81 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  31.66 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  31.66 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  30.81 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2776  hypothetical protein  25.59 
 
 		 275 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3199  hypothetical protein  28.14 
 
 		 700 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000232699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  25.32 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.44 
 
 		 699 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2751  hypothetical protein  26.48 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  27.91 
 
 		 728 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  29.47 
 
 		 638 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  25.32 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  25.32 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  25.32 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 659 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  29.49 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  30.32 
 
 		 764 aa  52.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2797  hypothetical protein  26.07 
 
 		 355 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  28.14 
 
 		 730 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  25.14 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  23.64 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  28.82 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  28.82 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  29.94 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  27.15 
 
 		 731 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  23.64 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.64 
 
 		 724 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  27.15 
 
 		 731 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  34.25 
 
 		 188 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  34.25 
 
 		 188 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  26.79 
 
 		 695 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  26.37 
 
 		 733 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  26.34 
 
 		 695 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.44 
 
 		 692 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  29.05 
 
 		 427 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  22.35 
 
 		 725 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  32.65 
 
 		 272 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  29.43 
 
 		 638 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  30 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  26 
 
 		 708 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.88 
 
 		 695 aa  49.7  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.93 
 
 		 672 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  32.65 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  32.67 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  29.81 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>