128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4212 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  98.46 
 
 
389 aa  780    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  792    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  98.46 
 
 
388 aa  751    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  95.37 
 
 
380 aa  728    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  82.11 
 
 
371 aa  608  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  80.95 
 
 
372 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  80.95 
 
 
372 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  80.95 
 
 
372 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  81 
 
 
374 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  61.11 
 
 
354 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  29.49 
 
 
388 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  28.98 
 
 
345 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  29.17 
 
 
356 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  31.52 
 
 
358 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  24.79 
 
 
355 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  28.51 
 
 
352 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  28.51 
 
 
352 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  28.51 
 
 
352 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  28.51 
 
 
352 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  28.51 
 
 
352 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  32.81 
 
 
374 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  29.2 
 
 
356 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  29.2 
 
 
356 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  31.96 
 
 
358 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  29.73 
 
 
356 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  29.73 
 
 
356 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  28.22 
 
 
357 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  28.22 
 
 
357 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  27.6 
 
 
352 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  27.6 
 
 
352 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  27.6 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  27.6 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  27.6 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  27.6 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  27.6 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  30.11 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  27.23 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  31.63 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  31.11 
 
 
362 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  31.02 
 
 
356 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  32.4 
 
 
226 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  29.63 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  29.63 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  29.63 
 
 
356 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  29.35 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  28.11 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  28.65 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  29.3 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  34.24 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  26.67 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  33.13 
 
 
377 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  32.52 
 
 
377 aa  63.2  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  26.29 
 
 
345 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  26.04 
 
 
679 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  26.29 
 
 
345 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  30.36 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  26.04 
 
 
679 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.04 
 
 
679 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  27.5 
 
 
677 aa  60.1  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.04 
 
 
679 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  27.91 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  26.36 
 
 
679 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  28.39 
 
 
733 aa  57  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  23.03 
 
 
681 aa  56.6  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  29.11 
 
 
725 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  29.11 
 
 
725 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  29.11 
 
 
725 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  29.11 
 
 
725 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  24.09 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  25.32 
 
 
361 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  25 
 
 
363 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  23.88 
 
 
670 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.15 
 
 
741 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  29.14 
 
 
718 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  31.11 
 
 
635 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  30.46 
 
 
700 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  29.2 
 
 
679 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.46 
 
 
700 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  28.14 
 
 
664 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  25.94 
 
 
670 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  24.33 
 
 
364 aa  50.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.27 
 
 
746 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  25 
 
 
638 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  24.1 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  26.44 
 
 
679 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  25.94 
 
 
663 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01615  conserved inner membrane protein  25.94 
 
 
670 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174689  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.94 
 
 
670 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  26.58 
 
 
734 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  28.14 
 
 
664 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.94 
 
 
670 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  27.01 
 
 
717 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  25.94 
 
 
670 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45597  predicted protein  24.71 
 
 
582 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>