123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3597 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  98.88 
 
 		 356 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  100 
 
 		 356 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  90.17 
 
 		 356 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  90.17 
 
 		 356 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  89.89 
 
 		 356 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  87.36 
 
 		 356 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  91.52 
 
 		 356 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  74.23 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  74.23 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  74.23 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  73.95 
 
 		 357 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  74.23 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  74.23 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  73.95 
 
 		 357 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  73.67 
 
 		 357 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  57.97 
 
 		 345 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  53.91 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  53.63 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  56.98 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  56.4 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  56.4 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  51.73 
 
 		 374 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  50.58 
 
 		 362 aa  322  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  50.43 
 
 		 374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  47.31 
 
 		 398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  45.24 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  34.04 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  28.31 
 
 		 411 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  32.75 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  28.65 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  28.74 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  28.74 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  28.74 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  28.32 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  28.32 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  32.03 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  31.64 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  27.95 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  31.64 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  31.64 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  31.64 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  30.58 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  31.64 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  31.64 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  30.92 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  29.73 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  26.69 
 
 		 372 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  26.39 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  29.73 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  29.73 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  34.64 
 
 		 226 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  29.73 
 
 		 389 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  29.73 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  29.73 
 
 		 389 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  29.73 
 
 		 388 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  30.04 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  34.78 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.38 
 
 		 724 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  26.4 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25.44 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.88 
 
 		 719 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  30.65 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  31.06 
 
 		 644 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  25.84 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.15 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  25.84 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  26.28 
 
 		 345 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  26.28 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  29.28 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.92 
 
 		 651 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.92 
 
 		 651 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.92 
 
 		 651 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.03 
 
 		 655 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  27.44 
 
 		 883 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.78 
 
 		 699 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  24.29 
 
 		 708 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.54 
 
 		 662 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.04 
 
 		 763 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.86 
 
 		 727 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  27.13 
 
 		 740 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.87 
 
 		 763 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  26.9 
 
 		 790 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.81 
 
 		 763 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  31.71 
 
 		 733 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  25.44 
 
 		 764 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.81 
 
 		 763 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  28.23 
 
 		 655 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.23 
 
 		 655 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.74 
 
 		 727 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  28.23 
 
 		 655 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.32 
 
 		 727 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 		 655 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.32 
 
 		 727 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 		 655 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 		 655 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 		 655 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0273  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.04 
 
 		 662 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.489457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.23 
 
 		 655 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  23.95 
 
 		 770 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.79 
 
 		 706 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>