78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2491 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  71.68 
 
 		 358 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  72.25 
 
 		 358 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  59.83 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  59.83 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  59.83 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  59.83 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  59.71 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  59.83 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  59.54 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  59.54 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  57.97 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  57.97 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  57.18 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  58.33 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  58.33 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  58.33 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  56.98 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  52.44 
 
 		 356 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  52.44 
 
 		 356 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  53.67 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  50.29 
 
 		 362 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  48.14 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  47.58 
 
 		 374 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  48.16 
 
 		 398 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  47.66 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  30.52 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  28.9 
 
 		 411 aa  149  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  37.04 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  29 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  33.86 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  33.86 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  33.86 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  33.86 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  33.86 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  31.97 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  30.5 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  31.63 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  31.63 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  31.63 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  31.63 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  31.63 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  31.63 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  27.25 
 
 		 352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  29.28 
 
 		 388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  35.2 
 
 		 226 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  31.19 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  31.19 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  31.19 
 
 		 388 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  31.19 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  27.79 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  30.35 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  30 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  30.35 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  30.35 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  30.35 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  24.44 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.35 
 
 		 746 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  23.89 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  28.93 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  26.8 
 
 		 679 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  31.08 
 
 		 644 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  29.3 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  27.56 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.14 
 
 		 679 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  27.56 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  26.14 
 
 		 679 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  26.74 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  27.22 
 
 		 728 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  26.14 
 
 		 679 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  28.07 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.14 
 
 		 679 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  25.47 
 
 		 717 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  27.61 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  25.47 
 
 		 717 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  25.47 
 
 		 717 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  25.47 
 
 		 717 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  25.47 
 
 		 717 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>