91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01897 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  99.72 
 
 
352 aa  717    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  100 
 
 
352 aa  718    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  99.15 
 
 
352 aa  714    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  99.72 
 
 
352 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  98.86 
 
 
352 aa  711    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  99.72 
 
 
352 aa  717    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  718    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  99.43 
 
 
352 aa  714    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  79.55 
 
 
352 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  79.83 
 
 
352 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  79.55 
 
 
352 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  79.55 
 
 
352 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  79.26 
 
 
352 aa  594  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  75 
 
 
352 aa  572  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  55.68 
 
 
355 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  99.46 
 
 
226 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1229  inner membrane protein YeeA  99.3 
 
 
142 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.365839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  31.75 
 
 
388 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  33.62 
 
 
374 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  33.19 
 
 
374 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  32.3 
 
 
356 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  32.3 
 
 
356 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  31.6 
 
 
362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  28.78 
 
 
357 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  29.32 
 
 
358 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  26.82 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  31.63 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  28.61 
 
 
357 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  28.61 
 
 
357 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  28.61 
 
 
357 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  28.61 
 
 
357 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  28.61 
 
 
357 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  33.33 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  28.33 
 
 
357 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  28.33 
 
 
357 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  30.8 
 
 
356 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  30.98 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  26.69 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  31.64 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  29.71 
 
 
398 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  32.91 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  31.07 
 
 
374 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  27.04 
 
 
356 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  27.04 
 
 
356 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  29.08 
 
 
356 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  30.92 
 
 
372 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  30.92 
 
 
372 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  30.92 
 
 
372 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  28.34 
 
 
356 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  30.58 
 
 
388 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  30.58 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  30.58 
 
 
389 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  30.58 
 
 
389 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  30.1 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  25.95 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  25.38 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  27.6 
 
 
444 aa  79.3  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  24.44 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  28.76 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  29.39 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  23.79 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  27.09 
 
 
725 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  27.09 
 
 
725 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  27.59 
 
 
725 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  22.22 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.46 
 
 
746 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  27.09 
 
 
725 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  26.51 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  27.55 
 
 
734 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  24.24 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.87 
 
 
719 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  24.32 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  25.34 
 
 
713 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.93 
 
 
744 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.52 
 
 
679 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  28.08 
 
 
730 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  25.84 
 
 
733 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 
734 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 
734 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  26.02 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 
734 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  29.22 
 
 
695 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  26.02 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  39.71 
 
 
725 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  24.02 
 
 
729 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  24.5 
 
 
728 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  29.22 
 
 
695 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  29.22 
 
 
695 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6403  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
692 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 
695 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.33 
 
 
708 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>