168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6403 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6403  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 692 aa  1316    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4127  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  56.43 
 
 		 741 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  39.34 
 
 		 688 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.99 
 
 		 699 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  31.09 
 
 		 700 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.33 
 
 		 746 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.61 
 
 		 708 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  28.99 
 
 		 600 aa  126  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.49 
 
 		 746 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.45 
 
 		 719 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.18 
 
 		 740 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.48 
 
 		 806 aa  107  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3931  hypothetical protein  30 
 
 		 629 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  24.51 
 
 		 758 aa  105  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  19.28 
 
 		 740 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  25.38 
 
 		 758 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  25.38 
 
 		 758 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  25.38 
 
 		 758 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  25.19 
 
 		 758 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  25.38 
 
 		 758 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  25.19 
 
 		 758 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  23.99 
 
 		 883 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  25.19 
 
 		 758 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.69 
 
 		 851 aa  101  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.14 
 
 		 763 aa  96.3  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.55 
 
 		 763 aa  96.3  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.37 
 
 		 763 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.65 
 
 		 730 aa  95.9  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.72 
 
 		 763 aa  94  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.49 
 
 		 764 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  30.4 
 
 		 659 aa  90.5  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.2 
 
 		 764 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.2 
 
 		 764 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  23.94 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1095  hypothetical protein  34.05 
 
 		 696 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  21.28 
 
 		 721 aa  81.6  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3199  hypothetical protein  26.33 
 
 		 700 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000232699  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  26.91 
 
 		 717 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  25.51 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  24.96 
 
 		 740 aa  77.8  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  29.58 
 
 		 733 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.48 
 
 		 738 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  25.08 
 
 		 711 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  30.03 
 
 		 733 aa  75.5  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  28.12 
 
 		 725 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  26.91 
 
 		 717 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.03 
 
 		 724 aa  75.1  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  23.84 
 
 		 770 aa  74.3  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  28.57 
 
 		 732 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  27.02 
 
 		 734 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.13 
 
 		 738 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  26.45 
 
 		 732 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  28.62 
 
 		 733 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  25.11 
 
 		 731 aa  70.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0284  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.33 
 
 		 744 aa  69.3  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  26.91 
 
 		 712 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  27.27 
 
 		 727 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  26.91 
 
 		 712 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  27.27 
 
 		 712 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  27.27 
 
 		 711 aa  68.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.38 
 
 		 737 aa  67.4  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3344  hypothetical protein  29.66 
 
 		 632 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.52 
 
 		 691 aa  66.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.57 
 
 		 706 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0499  membrane protein-like protein  26.42 
 
 		 695 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.57 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.11 
 
 		 706 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  25.7 
 
 		 711 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  27.27 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.87 
 
 		 756 aa  64.3  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30 
 
 		 744 aa  64.3  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.89 
 
 		 745 aa  64.3  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  27.31 
 
 		 717 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  26.51 
 
 		 717 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  27.31 
 
 		 717 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  29.11 
 
 		 631 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  26.51 
 
 		 717 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  27.71 
 
 		 717 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  26.51 
 
 		 717 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  27.31 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.01 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  27.31 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  27.31 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  27.31 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  27.31 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  27.41 
 
 		 717 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  27.31 
 
 		 720 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  27.31 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.41 
 
 		 727 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2704  membrane protein-like protein  21.59 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00615533  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.41 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.41 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.72 
 
 		 720 aa  60.1  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.41 
 
 		 727 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00757  hypothetical protein  29.59 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0943161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  25.93 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.45 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.45 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  26.46 
 
 		 695 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  25.66 
 
 		 733 aa  57.4  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>