122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2704 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2704  membrane protein-like protein  100 
 
 
655 aa  1314    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00615533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1137  hypothetical protein  21.46 
 
 
640 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0981  hypothetical protein  21.91 
 
 
620 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229606  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0763  hypothetical protein  23.44 
 
 
667 aa  73.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00848758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  22.92 
 
 
732 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.81 
 
 
727 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.71 
 
 
724 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  22.5 
 
 
732 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  25.18 
 
 
700 aa  68.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.97 
 
 
700 aa  68.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.81 
 
 
727 aa  68.2  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  25.1 
 
 
734 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.43 
 
 
699 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  21.93 
 
 
695 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  21.93 
 
 
695 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.93 
 
 
695 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.93 
 
 
695 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  23.65 
 
 
727 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.93 
 
 
695 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  23.85 
 
 
717 aa  64.7  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.12 
 
 
746 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  23.08 
 
 
721 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  27.08 
 
 
700 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.55 
 
 
756 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.43 
 
 
688 aa  62.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  28.18 
 
 
711 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  30.77 
 
 
721 aa  62.4  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.03 
 
 
719 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  29.2 
 
 
717 aa  61.6  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.3 
 
 
725 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  31.37 
 
 
733 aa  60.5  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  23.42 
 
 
712 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  24 
 
 
712 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  23.42 
 
 
712 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  21.72 
 
 
717 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  21.72 
 
 
717 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  21.72 
 
 
717 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  21.72 
 
 
717 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  21.72 
 
 
717 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1226  hypothetical protein  25.71 
 
 
636 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000692495  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  31.71 
 
 
725 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  28.07 
 
 
733 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.94 
 
 
696 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  23.78 
 
 
711 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.14 
 
 
720 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  22.4 
 
 
717 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  22.4 
 
 
720 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  22.4 
 
 
717 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  22.4 
 
 
720 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  22.4 
 
 
720 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  22.4 
 
 
720 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  22.4 
 
 
720 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  21.88 
 
 
731 aa  58.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6403  cyclic nucleotide-binding protein  21.59 
 
 
692 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  26.85 
 
 
737 aa  57.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  22.4 
 
 
720 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  27.83 
 
 
733 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  23.08 
 
 
720 aa  57.4  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1095  hypothetical protein  24.14 
 
 
696 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534792  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.87 
 
 
727 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  21.88 
 
 
720 aa  56.6  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  23.92 
 
 
700 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.92 
 
 
696 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  23.92 
 
 
700 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.92 
 
 
696 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.92 
 
 
696 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  23.18 
 
 
711 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.92 
 
 
696 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.92 
 
 
696 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.92 
 
 
696 aa  56.2  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.92 
 
 
696 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.57 
 
 
727 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.85 
 
 
730 aa  55.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.57 
 
 
727 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.57 
 
 
727 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.82 
 
 
740 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.68 
 
 
706 aa  55.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.03 
 
 
764 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.03 
 
 
764 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.03 
 
 
764 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.93 
 
 
763 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.5 
 
 
737 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.13 
 
 
708 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.05 
 
 
706 aa  52.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.05 
 
 
706 aa  52.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.03 
 
 
763 aa  52  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  27.03 
 
 
758 aa  52  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.13 
 
 
763 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.13 
 
 
763 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0462  hypothetical protein  28.89 
 
 
345 aa  51.2  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000893155  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.16 
 
 
695 aa  51.2  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  23.81 
 
 
352 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.02 
 
 
651 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.02 
 
 
651 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  29.47 
 
 
659 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.03 
 
 
806 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0450  hypothetical protein  26.67 
 
 
345 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.376108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.55 
 
 
746 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  32.91 
 
 
740 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  21.16 
 
 
733 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>