205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2135 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  66.43 
 
 		 717 aa  985    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  100 
 
 		 734 aa  1515    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  64.44 
 
 		 725 aa  970    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  66.86 
 
 		 717 aa  996    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  44.76 
 
 		 732 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  44.96 
 
 		 732 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  45.37 
 
 		 727 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  44.9 
 
 		 727 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  45.23 
 
 		 727 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  46.24 
 
 		 733 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  46.67 
 
 		 733 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  45.23 
 
 		 727 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  44.9 
 
 		 724 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  45.37 
 
 		 727 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0470  YccS/YhfK family integral membrane protein  44.02 
 
 		 722 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.393999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  43.79 
 
 		 717 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  43.43 
 
 		 717 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  43.69 
 
 		 717 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  43.43 
 
 		 717 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  43.77 
 
 		 717 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  43.24 
 
 		 720 aa  558  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  44.19 
 
 		 711 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  43.42 
 
 		 720 aa  557  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  43.13 
 
 		 721 aa  555  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  43.48 
 
 		 711 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  43.1 
 
 		 720 aa  554  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  42.96 
 
 		 717 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  42.96 
 
 		 720 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  42.82 
 
 		 720 aa  550  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  42.96 
 
 		 717 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  42.96 
 
 		 720 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  42.96 
 
 		 720 aa  551  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  42.96 
 
 		 720 aa  551  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  45.26 
 
 		 712 aa  545  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  46.08 
 
 		 711 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  43.26 
 
 		 731 aa  548  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  44.97 
 
 		 712 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  45.11 
 
 		 712 aa  545  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  45.99 
 
 		 733 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  41.09 
 
 		 737 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  39.27 
 
 		 725 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  43.87 
 
 		 756 aa  512  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  40.99 
 
 		 727 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  41.79 
 
 		 727 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  38.77 
 
 		 700 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  38.62 
 
 		 700 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  41.93 
 
 		 720 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  36.22 
 
 		 721 aa  440  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  32.98 
 
 		 733 aa  350  5e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.01 
 
 		 719 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.79 
 
 		 746 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.12 
 
 		 708 aa  177  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.99 
 
 		 746 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.6 
 
 		 763 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.3 
 
 		 764 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.83 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.62 
 
 		 764 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.62 
 
 		 764 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.47 
 
 		 763 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.47 
 
 		 763 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  24.51 
 
 		 758 aa  147  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  24.18 
 
 		 758 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  24.18 
 
 		 758 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  24.18 
 
 		 758 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  24.18 
 
 		 758 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  24.01 
 
 		 758 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  24.01 
 
 		 758 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  24.01 
 
 		 758 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.08 
 
 		 730 aa  143  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  25.49 
 
 		 695 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  25.49 
 
 		 695 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.49 
 
 		 695 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.49 
 
 		 695 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.32 
 
 		 695 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.18 
 
 		 696 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  26.18 
 
 		 700 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.18 
 
 		 696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  26.18 
 
 		 700 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.18 
 
 		 696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.18 
 
 		 696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.18 
 
 		 696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.18 
 
 		 696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.18 
 
 		 696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.55 
 
 		 696 aa  130  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  24.39 
 
 		 883 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.33 
 
 		 806 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.57 
 
 		 851 aa  127  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.01 
 
 		 706 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.59 
 
 		 695 aa  123  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.12 
 
 		 706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.98 
 
 		 706 aa  122  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  22.81 
 
 		 770 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  25.96 
 
 		 790 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  23.22 
 
 		 740 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  21.48 
 
 		 740 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.03 
 
 		 738 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.59 
 
 		 738 aa  108  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.76 
 
 		 737 aa  104  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.16 
 
 		 746 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.12 
 
 		 740 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>