220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2166 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  100 
 
 		 719 aa  1462    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  41.86 
 
 		 708 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  37.03 
 
 		 746 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.24 
 
 		 746 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.37 
 
 		 763 aa  335  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.21 
 
 		 763 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.76 
 
 		 763 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.23 
 
 		 764 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30.45 
 
 		 763 aa  326  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30.56 
 
 		 764 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30.56 
 
 		 764 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  28.82 
 
 		 758 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  28.82 
 
 		 758 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  28.82 
 
 		 758 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  28.82 
 
 		 758 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  28.82 
 
 		 758 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  28.69 
 
 		 758 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  28.69 
 
 		 758 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  28.5 
 
 		 758 aa  320  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  28.78 
 
 		 740 aa  303  8.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  31.34 
 
 		 883 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.67 
 
 		 851 aa  296  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  29.25 
 
 		 770 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  28.74 
 
 		 790 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.73 
 
 		 806 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.08 
 
 		 738 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.34 
 
 		 738 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  27.99 
 
 		 740 aa  267  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.85 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  25.11 
 
 		 717 aa  226  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  25.81 
 
 		 717 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  24.8 
 
 		 725 aa  205  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  23.9 
 
 		 721 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  25.56 
 
 		 731 aa  191  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  24.65 
 
 		 711 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  24.92 
 
 		 711 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  23.01 
 
 		 734 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  24.67 
 
 		 712 aa  182  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  24.5 
 
 		 712 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  24.51 
 
 		 717 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  24.11 
 
 		 720 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  24.51 
 
 		 717 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  24.51 
 
 		 717 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  24.83 
 
 		 712 aa  180  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  24.51 
 
 		 717 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  24.75 
 
 		 717 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  24.67 
 
 		 711 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  24.11 
 
 		 717 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  24.11 
 
 		 720 aa  179  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  24.11 
 
 		 720 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  24.11 
 
 		 717 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  24.11 
 
 		 720 aa  179  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  24.11 
 
 		 720 aa  179  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  24.26 
 
 		 720 aa  178  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  25.44 
 
 		 733 aa  177  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  23.97 
 
 		 720 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  25.45 
 
 		 721 aa  176  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.08 
 
 		 724 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  24.56 
 
 		 720 aa  176  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.07 
 
 		 727 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.02 
 
 		 727 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.19 
 
 		 727 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.33 
 
 		 727 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  21.85 
 
 		 732 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.84 
 
 		 727 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  21.82 
 
 		 727 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.84 
 
 		 727 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  21.92 
 
 		 733 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.84 
 
 		 746 aa  141  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  21.75 
 
 		 732 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  22.22 
 
 		 733 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  21.83 
 
 		 733 aa  140  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.41 
 
 		 744 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0470  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.5 
 
 		 722 aa  137  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.393999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  23.28 
 
 		 737 aa  130  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.05 
 
 		 737 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  22.89 
 
 		 700 aa  127  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2243  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.23 
 
 		 768 aa  126  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  hitchhiker  0.00000657541 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  23 
 
 		 700 aa  126  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.58 
 
 		 756 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.31 
 
 		 706 aa  117  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.11 
 
 		 725 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.34 
 
 		 706 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.19 
 
 		 706 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.83 
 
 		 720 aa  112  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.2 
 
 		 740 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.37 
 
 		 695 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  21.37 
 
 		 695 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.37 
 
 		 695 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.22 
 
 		 695 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.4 
 
 		 695 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  21.22 
 
 		 695 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  21.48 
 
 		 700 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.48 
 
 		 696 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  21.48 
 
 		 700 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.48 
 
 		 696 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.48 
 
 		 696 aa  102  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.48 
 
 		 696 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.48 
 
 		 696 aa  102  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.48 
 
 		 696 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>