187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05920 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  74.86 
 
 		 727 aa  1095    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  74.41 
 
 		 732 aa  1110    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  74.27 
 
 		 732 aa  1108    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  75.07 
 
 		 727 aa  1100    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  74.41 
 
 		 727 aa  1093    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  63.31 
 
 		 733 aa  847    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  71.57 
 
 		 724 aa  1022    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  74.27 
 
 		 727 aa  1076    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  100 
 
 		 733 aa  1473    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  50.98 
 
 		 700 aa  641    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  59.16 
 
 		 756 aa  716    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  55.52 
 
 		 727 aa  685    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  56.88 
 
 		 737 aa  783    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  55.52 
 
 		 727 aa  699    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  53.59 
 
 		 725 aa  728    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0470  YccS/YhfK family integral membrane protein  74.45 
 
 		 722 aa  1058    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.393999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  74.86 
 
 		 727 aa  1095    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  97.41 
 
 		 733 aa  1392    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  50.98 
 
 		 700 aa  643    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  51.54 
 
 		 720 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  44.66 
 
 		 717 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  46.24 
 
 		 734 aa  617  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  44.77 
 
 		 725 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  44.85 
 
 		 717 aa  617  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  44.14 
 
 		 717 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  44.14 
 
 		 720 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  44.14 
 
 		 720 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  43.67 
 
 		 720 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  43.52 
 
 		 720 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  44.14 
 
 		 717 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  43.81 
 
 		 720 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  44.14 
 
 		 720 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  43.81 
 
 		 720 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  41.83 
 
 		 711 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  43.3 
 
 		 717 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  42.86 
 
 		 712 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  43.3 
 
 		 717 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  43.45 
 
 		 717 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  43.3 
 
 		 717 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  43.3 
 
 		 717 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  41.59 
 
 		 721 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  42.71 
 
 		 712 aa  504  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  42.71 
 
 		 712 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  42.19 
 
 		 720 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  41.97 
 
 		 711 aa  500  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  41.16 
 
 		 711 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  40.03 
 
 		 731 aa  482  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  32.54 
 
 		 721 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  30.38 
 
 		 733 aa  313  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.64 
 
 		 708 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.25 
 
 		 746 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.05 
 
 		 746 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  24.33 
 
 		 770 aa  156  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.07 
 
 		 730 aa  153  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.77 
 
 		 719 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.01 
 
 		 763 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  23.74 
 
 		 758 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.12 
 
 		 763 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  24.01 
 
 		 758 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.05 
 
 		 763 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  24.01 
 
 		 758 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  24.01 
 
 		 758 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.62 
 
 		 740 aa  134  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  24.01 
 
 		 758 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  24.01 
 
 		 758 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  24.01 
 
 		 758 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  24.01 
 
 		 758 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.79 
 
 		 763 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  24.43 
 
 		 790 aa  131  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.49 
 
 		 696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  26.29 
 
 		 695 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  26.29 
 
 		 695 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.29 
 
 		 695 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.29 
 
 		 695 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.89 
 
 		 764 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.29 
 
 		 695 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  24.31 
 
 		 883 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.76 
 
 		 764 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.76 
 
 		 764 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  27.61 
 
 		 700 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  27.69 
 
 		 740 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  27.61 
 
 		 700 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.21 
 
 		 738 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.1 
 
 		 696 aa  120  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.1 
 
 		 696 aa  120  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.1 
 
 		 696 aa  120  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.1 
 
 		 696 aa  120  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.1 
 
 		 696 aa  120  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.1 
 
 		 696 aa  120  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.49 
 
 		 738 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.1 
 
 		 696 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.89 
 
 		 851 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.9 
 
 		 695 aa  117  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.21 
 
 		 806 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.5 
 
 		 706 aa  111  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.8 
 
 		 706 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.29 
 
 		 746 aa  110  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.13 
 
 		 706 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.65 
 
 		 737 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.34 
 
 		 744 aa  95.1  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>