125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4696 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  100 
 
 
745 aa  1419    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0258  hypothetical protein  41.57 
 
 
829 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828361  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7033  hypothetical protein  37.31 
 
 
874 aa  347  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4074  membrane protein-like  43.49 
 
 
889 aa  340  7e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  38.38 
 
 
749 aa  325  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  38.13 
 
 
715 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0746  membrane protein-like protein  37.21 
 
 
712 aa  277  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  34.8 
 
 
776 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  46.51 
 
 
718 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  46.51 
 
 
718 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  46.51 
 
 
718 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  36.25 
 
 
727 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.11 
 
 
746 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3554  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  37.27 
 
 
728 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0186862  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  33.22 
 
 
756 aa  68.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  26.8 
 
 
700 aa  66.6  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  26.67 
 
 
725 aa  65.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  24.36 
 
 
717 aa  64.3  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  20.51 
 
 
717 aa  63.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  29.05 
 
 
731 aa  62.4  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  28.49 
 
 
721 aa  61.6  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.56 
 
 
719 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.33 
 
 
706 aa  60.8  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  20.09 
 
 
721 aa  60.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.11 
 
 
727 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.45 
 
 
746 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.11 
 
 
727 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.33 
 
 
706 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.33 
 
 
706 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  33.71 
 
 
631 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.44 
 
 
699 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.48 
 
 
708 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  23.81 
 
 
395 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0564  hypothetical protein  21.28 
 
 
653 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.21 
 
 
763 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  25.46 
 
 
695 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.46 
 
 
695 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.21 
 
 
763 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  25.46 
 
 
695 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.46 
 
 
695 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.21 
 
 
730 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.21 
 
 
763 aa  57.4  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.53 
 
 
763 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  23.23 
 
 
712 aa  57  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  32.2 
 
 
431 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.81 
 
 
764 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.81 
 
 
764 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  23.23 
 
 
712 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  24.26 
 
 
712 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.81 
 
 
764 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  25 
 
 
695 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  25.1 
 
 
711 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  26.53 
 
 
758 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.86 
 
 
359 aa  55.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.81 
 
 
695 aa  55.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  54.7  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  27.73 
 
 
700 aa  54.3  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  27 
 
 
720 aa  54.3  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  21.82 
 
 
711 aa  53.9  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  25.34 
 
 
883 aa  53.9  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  24.75 
 
 
680 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.34 
 
 
851 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  26.5 
 
 
717 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  26.5 
 
 
720 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.22 
 
 
727 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  26.53 
 
 
758 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  26.5 
 
 
717 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  26.53 
 
 
758 aa  53.5  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  26.53 
 
 
758 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  26.53 
 
 
758 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  26.53 
 
 
758 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  26.53 
 
 
758 aa  53.5  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  26.53 
 
 
758 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.22 
 
 
727 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  26.5 
 
 
720 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  26.5 
 
 
720 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.22 
 
 
727 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  26.5 
 
 
720 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  26.5 
 
 
720 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2059  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.84 
 
 
657 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000771664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.66 
 
 
806 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  28.25 
 
 
600 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  26.5 
 
 
720 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  24.89 
 
 
732 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.78 
 
 
727 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.917341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  24.88 
 
 
700 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.88 
 
 
696 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  24.89 
 
 
732 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  24.88 
 
 
700 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.88 
 
 
696 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.88 
 
 
696 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.88 
 
 
696 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.88 
 
 
696 aa  51.6  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.88 
 
 
696 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.64 
 
 
720 aa  51.2  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  25 
 
 
711 aa  51.2  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  26.67 
 
 
717 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  26.67 
 
 
717 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  26.67 
 
 
717 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  26.67 
 
 
717 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>