17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1229 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  99.3 
 
 		 352 aa  294  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  99.3 
 
 		 352 aa  294  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1229  inner membrane protein YeeA  100 
 
 		 142 aa  294  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.365839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  99.3 
 
 		 352 aa  294  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  99.3 
 
 		 352 aa  294  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  99.3 
 
 		 352 aa  294  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  98.59 
 
 		 352 aa  292  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  98.59 
 
 		 352 aa  291  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  97.89 
 
 		 352 aa  291  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  75.35 
 
 		 352 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  75.35 
 
 		 352 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  75.35 
 
 		 352 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  75.35 
 
 		 352 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  75.35 
 
 		 352 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  69.72 
 
 		 352 aa  210  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  45.77 
 
 		 355 aa  124  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  29.37 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>