172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2149 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  767    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  31.98 
 
 
355 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  28.57 
 
 
354 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  31.69 
 
 
352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  31.75 
 
 
352 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  31.75 
 
 
352 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  31.75 
 
 
352 aa  146  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 
352 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  31.75 
 
 
352 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  31.75 
 
 
352 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  31.75 
 
 
352 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  30.11 
 
 
372 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  30.3 
 
 
372 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  29.51 
 
 
372 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  29.22 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  28.23 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  29.22 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  29.22 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  29.22 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  29.22 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  29.19 
 
 
389 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  28.31 
 
 
352 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  28.83 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  28.57 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  28.21 
 
 
389 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  28.49 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  30.29 
 
 
374 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  29.53 
 
 
374 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  32.93 
 
 
362 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  29.28 
 
 
345 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  31.43 
 
 
357 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  31.43 
 
 
357 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  31.43 
 
 
357 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  31.43 
 
 
357 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  31.43 
 
 
357 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  29.55 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  31.43 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  30.52 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  31.02 
 
 
357 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  31.02 
 
 
357 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  30.92 
 
 
356 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  30.4 
 
 
358 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  32.17 
 
 
356 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  30.92 
 
 
356 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  32.17 
 
 
356 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  29.06 
 
 
411 aa  107  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  32.4 
 
 
361 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  34.16 
 
 
398 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  29.59 
 
 
403 aa  104  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  25.85 
 
 
444 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  28.05 
 
 
339 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  31.54 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  31.54 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  31.18 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  31.73 
 
 
356 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  34.02 
 
 
226 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  29.51 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  29.1 
 
 
377 aa  84  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  26.44 
 
 
338 aa  77  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  26.4 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  27.33 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  34.36 
 
 
732 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  31.9 
 
 
727 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  34.36 
 
 
732 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  25.88 
 
 
347 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  27.19 
 
 
708 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  30.49 
 
 
717 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.76 
 
 
727 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.11 
 
 
359 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  29.79 
 
 
733 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  32.43 
 
 
727 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.43 
 
 
727 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.43 
 
 
727 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  29.27 
 
 
717 aa  60.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  26.57 
 
 
670 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  28.66 
 
 
725 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  29.26 
 
 
733 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  31.72 
 
 
724 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  28.3 
 
 
725 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  25.79 
 
 
360 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  26.14 
 
 
679 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  28.3 
 
 
725 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  34.46 
 
 
720 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  27.68 
 
 
728 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  27.68 
 
 
729 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25.29 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.14 
 
 
679 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.14 
 
 
679 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  26.14 
 
 
679 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  28.3 
 
 
725 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1229  inner membrane protein YeeA  29.37 
 
 
142 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.365839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  30 
 
 
733 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  25.82 
 
 
679 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  24.28 
 
 
681 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  27.06 
 
 
725 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.15 
 
 
719 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  25.66 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  29.18 
 
 
699 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45597  predicted protein  24.21 
 
 
582 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.2 
 
 
727 aa  53.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>