81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1227 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  99.46 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  99.46 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  98.91 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  83.7 
 
 		 352 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  83.7 
 
 		 352 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  83.15 
 
 		 352 aa  331  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  83.15 
 
 		 352 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  82.61 
 
 		 352 aa  329  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  75 
 
 		 352 aa  316  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  63.59 
 
 		 355 aa  255  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  37.79 
 
 		 374 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  36.41 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  35.06 
 
 		 357 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  35.06 
 
 		 357 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  35.06 
 
 		 357 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  35.06 
 
 		 357 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  35.06 
 
 		 357 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  35.06 
 
 		 357 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  35.71 
 
 		 358 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  34.24 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  36 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  36 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  34.48 
 
 		 357 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  34.48 
 
 		 357 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  36.75 
 
 		 362 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  35.2 
 
 		 345 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  33.71 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  33.91 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  34.64 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  32.4 
 
 		 374 aa  98.2  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  32.4 
 
 		 372 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  32.4 
 
 		 372 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  32.4 
 
 		 372 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  32.02 
 
 		 356 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  32.02 
 
 		 356 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  32.02 
 
 		 356 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  37.79 
 
 		 398 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  31.84 
 
 		 371 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  33.33 
 
 		 339 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  32.4 
 
 		 389 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  32.4 
 
 		 380 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  32.4 
 
 		 389 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  32.4 
 
 		 388 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  34.02 
 
 		 388 aa  91.7  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  29.89 
 
 		 354 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  31.03 
 
 		 356 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  33.91 
 
 		 361 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  26.07 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  28.14 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  31.36 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  32 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  28.43 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  27.42 
 
 		 377 aa  52  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  26.88 
 
 		 377 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.53 
 
 		 746 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  25.68 
 
 		 360 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  26.03 
 
 		 713 aa  48.5  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  24.86 
 
 		 395 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  26.96 
 
 		 725 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  26.96 
 
 		 725 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  27.45 
 
 		 725 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  28.27 
 
 		 695 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  31.33 
 
 		 730 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  28.27 
 
 		 695 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.87 
 
 		 719 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  27.75 
 
 		 695 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  26.96 
 
 		 725 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  39.71 
 
 		 725 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.65 
 
 		 679 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  29.22 
 
 		 695 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  24.39 
 
 		 740 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  25.47 
 
 		 338 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6403  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 692 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  29.53 
 
 		 734 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  28.99 
 
 		 676 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>